79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0682 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1064    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  54.06 
 
 		 548 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  56.53 
 
 		 561 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  47.31 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  46.05 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  44.04 
 
 		 636 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  48.22 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  46.83 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  44.91 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  47.27 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  46.64 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  44.55 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  45.63 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  45.15 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  45.68 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  43.92 
 
 		 577 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  43.51 
 
 		 565 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  43.99 
 
 		 569 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  43.99 
 
 		 569 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  43.99 
 
 		 569 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  42.49 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  44.27 
 
 		 568 aa  343  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  24.54 
 
 		 678 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  26.6 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  26 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  24.44 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  23.34 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  23.81 
 
 		 661 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  26.91 
 
 		 633 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  23.08 
 
 		 648 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  23.62 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  26.55 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  26.55 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  24.24 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  27.14 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  24.66 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  24.5 
 
 		 628 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  25.49 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  24.46 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  24.04 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  24.04 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  24.46 
 
 		 628 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  23.53 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  25.27 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  27.21 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  26.09 
 
 		 668 aa  67  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  23.03 
 
 		 649 aa  67  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  27.06 
 
 		 477 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  23.74 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  26.44 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  25.46 
 
 		 671 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.98 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  38.78 
 
 		 621 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  25.82 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  27.12 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  25.75 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  25.18 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  24.71 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.49 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  24.73 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  24.73 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  25.09 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.88 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  37.84 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  28.68 
 
 		 489 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  28.68 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  25.32 
 
 		 474 aa  53.9  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  21.86 
 
 		 773 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  37.68 
 
 		 777 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  27.11 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  26.54 
 
 		 460 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  25.33 
 
 		 528 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.83 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  24.03 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  31.33 
 
 		 523 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  23.49 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  25 
 
 		 529 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 618 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  23.9 
 
 		 534 aa  44.3  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>