75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1409 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1087    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  53.45 
 
 		 542 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  52.8 
 
 		 540 aa  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  51.66 
 
 		 569 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  51.66 
 
 		 569 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  51.66 
 
 		 569 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  52.69 
 
 		 540 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  49.73 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  48.22 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  45.42 
 
 		 559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  44.42 
 
 		 590 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  45.02 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  44.17 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  44.69 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  46.17 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  44.92 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  45.93 
 
 		 561 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  45.88 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  42.78 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  41.39 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  38.93 
 
 		 636 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  42.96 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  29 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  26.94 
 
 		 622 aa  84  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  28 
 
 		 615 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  27.52 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  25.48 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  29.01 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  25.62 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  28.48 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.94 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  24.1 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  28.86 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  26.09 
 
 		 633 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  27.42 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  25.12 
 
 		 714 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  27.87 
 
 		 668 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  26.4 
 
 		 616 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  26.71 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  26.71 
 
 		 628 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  26.63 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  28.97 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  28.83 
 
 		 648 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.09 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  25.87 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  26.58 
 
 		 621 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  24.79 
 
 		 708 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  27.05 
 
 		 648 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  25.94 
 
 		 616 aa  67.4  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  28.14 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  22.81 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  26.21 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  26.09 
 
 		 671 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  23.47 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  24.91 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  23.47 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  26.8 
 
 		 670 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  28.05 
 
 		 655 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  26.1 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.12 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  25.8 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  27.33 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  24.31 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  25.37 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  23.43 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  25.45 
 
 		 529 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  23.42 
 
 		 777 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  25.37 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  27.05 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  25.54 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  21.19 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  34.48 
 
 		 573 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  31.01 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  31.01 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  30.72 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>