23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2999 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  952    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  53.09 
 
 
473 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  45.15 
 
 
500 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  45.15 
 
 
534 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  28.09 
 
 
492 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  27.97 
 
 
529 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87049  predicted protein  23.49 
 
 
704 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0290903  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09466  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 
562 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03582  conserved hypothetical protein  20.75 
 
 
1229 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1866  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  42 
 
 
114 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.892343  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  26.82 
 
 
535 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05776  WW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G06520)  27.23 
 
 
1208 aa  60.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00770  plasma membrane protein, putative  21.6 
 
 
692 aa  60.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  35.92 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  26.75 
 
 
531 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  27.27 
 
 
702 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.49 
 
 
520 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  37.21 
 
 
559 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  24.8 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  30.2 
 
 
561 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  27.7 
 
 
590 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  36.08 
 
 
552 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  34.07 
 
 
540 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>