38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2438 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  1027    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  34.95 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  29.54 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  29.54 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  27.62 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  28.09 
 
 		 474 aa  163  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87049  predicted protein  25.19 
 
 		 704 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0290903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00770  plasma membrane protein, putative  27.13 
 
 		 692 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867124  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03582  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 1229 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406645  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05776  WW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G06520)  24.07 
 
 		 1208 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09466  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 562 aa  90.5  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  25.51 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  24.95 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  26.09 
 
 		 550 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  22.81 
 
 		 531 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  22.41 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  26.03 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.25 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.22 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  23.53 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  21.83 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  36.36 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  38.71 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  30.43 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  25.36 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  21.53 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  21.53 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  21.53 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  23.6 
 
 		 534 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  30.53 
 
 		 636 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  37.36 
 
 		 542 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  39.53 
 
 		 565 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  23.59 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  22.72 
 
 		 540 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  24.57 
 
 		 678 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  37.8 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  24.04 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  24.04 
 
 		 489 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>