70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5029 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  100 
 
 
678 aa  1394    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  30.74 
 
 
623 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  31.62 
 
 
619 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  31.61 
 
 
617 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  31.32 
 
 
668 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  30.6 
 
 
650 aa  204  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  31.12 
 
 
616 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  31.05 
 
 
616 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  30.36 
 
 
661 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  29.62 
 
 
659 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  30.34 
 
 
648 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  29.37 
 
 
626 aa  194  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  28.96 
 
 
646 aa  193  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  28.49 
 
 
649 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  29.81 
 
 
639 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  30 
 
 
648 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  27.92 
 
 
633 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  28.16 
 
 
655 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  29.53 
 
 
671 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  29.07 
 
 
615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  27.94 
 
 
622 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  28.83 
 
 
670 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  31.53 
 
 
577 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  28.28 
 
 
632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  28.21 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  27.01 
 
 
628 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  28.65 
 
 
628 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  27.09 
 
 
628 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  27.24 
 
 
616 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  29.84 
 
 
616 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  29.22 
 
 
714 aa  168  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  28.17 
 
 
708 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  28.52 
 
 
616 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  28.62 
 
 
773 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  29.21 
 
 
621 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  26.95 
 
 
706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  31.58 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  25.16 
 
 
777 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  28.26 
 
 
370 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  25 
 
 
542 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  26.06 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  26.76 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  25.38 
 
 
636 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  27.95 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  27.24 
 
 
546 aa  82  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.18 
 
 
520 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  25.9 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  25.9 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  25.9 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  24.53 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  25.64 
 
 
534 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  25.86 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  26.36 
 
 
559 aa  77.4  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  24.34 
 
 
548 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  28.97 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  25.21 
 
 
561 aa  73.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  25.28 
 
 
590 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  28.76 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  24.05 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  26.14 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  26.1 
 
 
568 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  33.61 
 
 
233 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  30.41 
 
 
154 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.86 
 
 
475 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.57 
 
 
702 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  38.98 
 
 
469 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  24.57 
 
 
492 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  24.24 
 
 
460 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  43.9 
 
 
489 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  43.9 
 
 
489 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>