77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1967 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1130    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  55.86 
 
 
550 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  47 
 
 
535 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  50.19 
 
 
534 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  47.07 
 
 
565 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  44.09 
 
 
520 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  42.37 
 
 
548 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  44.33 
 
 
577 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  44.44 
 
 
590 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  42.57 
 
 
552 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  44.39 
 
 
546 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  43.04 
 
 
569 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  43.04 
 
 
569 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  43.04 
 
 
569 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  42.65 
 
 
542 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  44.83 
 
 
540 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  42.78 
 
 
531 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  43.49 
 
 
540 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  42.59 
 
 
559 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  38.96 
 
 
636 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  43.69 
 
 
568 aa  343  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  42.88 
 
 
561 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  23.62 
 
 
628 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  24.83 
 
 
623 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  23.45 
 
 
628 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  27.3 
 
 
648 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  26.76 
 
 
678 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  26.91 
 
 
646 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  26.67 
 
 
622 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  23.36 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  23.36 
 
 
616 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  28.67 
 
 
632 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  27.14 
 
 
370 aa  80.1  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  24.95 
 
 
492 aa  77  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  28.36 
 
 
639 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.03 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  28.47 
 
 
648 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  26.57 
 
 
621 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  30.14 
 
 
477 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  27.21 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  25.81 
 
 
661 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  26.62 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  25.7 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  28.41 
 
 
668 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  28.16 
 
 
659 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  26.09 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  27.82 
 
 
619 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  27.88 
 
 
650 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  26.24 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  26.89 
 
 
616 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  25.85 
 
 
617 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  26.24 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  27.27 
 
 
671 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  27.24 
 
 
670 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  25.75 
 
 
616 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  27.81 
 
 
708 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  26.35 
 
 
577 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  25.08 
 
 
706 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  27.17 
 
 
655 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  22.77 
 
 
714 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  27.51 
 
 
489 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  27.17 
 
 
489 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.72 
 
 
469 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  24.93 
 
 
529 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  23.93 
 
 
616 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  22.08 
 
 
773 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  35.92 
 
 
474 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  23.92 
 
 
460 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  30.2 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.68 
 
 
702 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  22.05 
 
 
777 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  26.13 
 
 
541 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  24.54 
 
 
514 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  36.23 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 
558 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  24.38 
 
 
539 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  38.75 
 
 
447 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>