81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2527 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1089    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  67.59 
 
 
542 aa  742    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  64.27 
 
 
569 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  67.34 
 
 
540 aa  731    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  64.27 
 
 
569 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  64.27 
 
 
569 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  52.69 
 
 
531 aa  525  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  48.08 
 
 
577 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  47.48 
 
 
559 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  45.37 
 
 
552 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  47.63 
 
 
534 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  47.86 
 
 
590 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  44.04 
 
 
548 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  44.67 
 
 
546 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  45.75 
 
 
520 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  44.65 
 
 
566 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  41.15 
 
 
636 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  43.16 
 
 
535 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  42.91 
 
 
550 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  41.1 
 
 
565 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  43.61 
 
 
561 aa  349  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  39.78 
 
 
568 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  25.86 
 
 
678 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.84 
 
 
661 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  28.12 
 
 
650 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.88 
 
 
702 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  27.76 
 
 
623 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  27.92 
 
 
628 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  22.64 
 
 
622 aa  73.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  26.05 
 
 
649 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  25.49 
 
 
714 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  23.61 
 
 
619 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  27.27 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  24.54 
 
 
646 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  24.05 
 
 
616 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  26.84 
 
 
489 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  23.59 
 
 
628 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.08 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  23.93 
 
 
648 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  25.09 
 
 
626 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  25.93 
 
 
615 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  25.8 
 
 
633 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  25.93 
 
 
615 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  29.86 
 
 
668 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  24 
 
 
616 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  23.59 
 
 
628 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.52 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  27.34 
 
 
632 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  27.6 
 
 
639 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  27.06 
 
 
460 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  24.41 
 
 
577 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  23.62 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  25.36 
 
 
617 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  26.33 
 
 
671 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  22.03 
 
 
616 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  27.49 
 
 
655 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  25.55 
 
 
621 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  26.24 
 
 
670 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  24.42 
 
 
706 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  26.91 
 
 
616 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  28.04 
 
 
648 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  24.81 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  24.6 
 
 
616 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  22.72 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  34.72 
 
 
708 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  26.2 
 
 
659 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  26.39 
 
 
477 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  20.87 
 
 
773 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  24.56 
 
 
777 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  27.15 
 
 
520 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  25.85 
 
 
529 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  32.84 
 
 
534 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  32.84 
 
 
500 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.91 
 
 
540 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  22.35 
 
 
558 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11069  alkaline phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03860)  23.53 
 
 
619 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 
527 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  24.89 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  27.59 
 
 
574 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  30.97 
 
 
532 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  30.49 
 
 
520 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>