68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2427 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1266    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  43.8 
 
 		 548 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  44.25 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  41.15 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  42.51 
 
 		 534 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  44.04 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  40.13 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  39.72 
 
 		 565 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  39.27 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  39.85 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  40.76 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  39.03 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  39.3 
 
 		 542 aa  369  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  40.09 
 
 		 590 aa  365  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  38.96 
 
 		 566 aa  357  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  39.75 
 
 		 540 aa  353  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  38.45 
 
 		 531 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  38.51 
 
 		 550 aa  349  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  37.98 
 
 		 569 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  37.98 
 
 		 569 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  37.98 
 
 		 569 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  39.07 
 
 		 568 aa  340  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  25.38 
 
 		 678 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  26.48 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  29.3 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  27.75 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  28.5 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  22.78 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  24.73 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  23.84 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  40 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  23.84 
 
 		 708 aa  57.4  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  21.12 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  36.67 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  36.67 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  22.65 
 
 		 655 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  36.67 
 
 		 633 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  37.29 
 
 		 623 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  23.16 
 
 		 577 aa  55.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  42.37 
 
 		 648 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  34.78 
 
 		 622 aa  54.3  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.71 
 
 		 475 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.19 
 
 		 471 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  35.59 
 
 		 661 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  35.59 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  35.59 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  35.59 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  35.59 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  31.53 
 
 		 621 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  30.53 
 
 		 492 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  23.96 
 
 		 650 aa  50.4  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  38.98 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  23.91 
 
 		 668 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  34.62 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  24.65 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  24.21 
 
 		 659 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  41.82 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  23.6 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  40.74 
 
 		 671 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  23.8 
 
 		 616 aa  47.4  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  31.65 
 
 		 616 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  38.89 
 
 		 670 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.7 
 
 		 469 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2828  hypothetical protein  66.67 
 
 		 123 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16698  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  37.29 
 
 		 619 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  30.38 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  36.36 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  27.59 
 
 		 777 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>