64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02514 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  75.93 
 
 
646 aa  1055    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1358    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  56.42 
 
 
622 aa  725    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  49.92 
 
 
628 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  49.77 
 
 
628 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  48.99 
 
 
628 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  49.21 
 
 
649 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  48.54 
 
 
633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  49.37 
 
 
616 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  49.37 
 
 
616 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  47.74 
 
 
661 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  45.86 
 
 
671 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  48.13 
 
 
626 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  48.67 
 
 
615 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  48.82 
 
 
615 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  49.37 
 
 
623 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  44.64 
 
 
616 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  45.27 
 
 
617 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  45.55 
 
 
670 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  44.88 
 
 
616 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  46.21 
 
 
655 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  44.69 
 
 
659 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  45.87 
 
 
639 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  45.4 
 
 
650 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  54.39 
 
 
577 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  44.48 
 
 
668 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  45.21 
 
 
648 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  43.95 
 
 
619 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  43.95 
 
 
708 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  43.24 
 
 
632 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  48.03 
 
 
714 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  47.72 
 
 
477 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
370 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  30 
 
 
678 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 
621 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  27.61 
 
 
616 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  29.56 
 
 
706 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  26.29 
 
 
773 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  24.44 
 
 
777 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  34.84 
 
 
233 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  27.3 
 
 
566 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  24.61 
 
 
590 aa  87.8  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  28.84 
 
 
534 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  28.06 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.67 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  23.37 
 
 
577 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  23.43 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  24.82 
 
 
559 aa  75.1  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  24.73 
 
 
565 aa  74.7  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  24.45 
 
 
550 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  25.91 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  28.32 
 
 
531 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  25.44 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  25.44 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  25.44 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  28.47 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  23.93 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  24.55 
 
 
552 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  23.3 
 
 
548 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  24.83 
 
 
540 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  26.59 
 
 
561 aa  62.4  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  42.37 
 
 
636 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.98 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  25.39 
 
 
568 aa  44.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>