81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2328 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  100 
 
 
520 aa  1061    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  49.63 
 
 
535 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  51.8 
 
 
534 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  47.05 
 
 
565 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  44.09 
 
 
566 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  43.22 
 
 
550 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  46.64 
 
 
548 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  45.34 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  45.64 
 
 
561 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  42.09 
 
 
552 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  43.79 
 
 
559 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  43.98 
 
 
542 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  46.64 
 
 
546 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  45.37 
 
 
540 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  39.27 
 
 
636 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  41.89 
 
 
577 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  43.54 
 
 
568 aa  363  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  42.49 
 
 
590 aa  356  5.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  40.75 
 
 
569 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  40.75 
 
 
569 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  40.75 
 
 
569 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  43.5 
 
 
540 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  27.04 
 
 
646 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  24.18 
 
 
678 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  28.73 
 
 
626 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  28.15 
 
 
632 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  26.71 
 
 
370 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  26.67 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  28.31 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.74 
 
 
661 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  28.31 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  28.83 
 
 
633 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  26.47 
 
 
622 aa  76.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  26.67 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  27.18 
 
 
714 aa  74.3  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  28.17 
 
 
650 aa  74.3  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  24.83 
 
 
649 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  28.76 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  28.1 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  26.98 
 
 
577 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  24.44 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  25.9 
 
 
628 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  27.34 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  25.9 
 
 
628 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  26.26 
 
 
616 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  25.91 
 
 
489 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  27.81 
 
 
639 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  25.91 
 
 
489 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  27.39 
 
 
706 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  28.52 
 
 
671 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  27.78 
 
 
670 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  28.3 
 
 
668 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  25.18 
 
 
616 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  24.78 
 
 
773 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  30.38 
 
 
475 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.65 
 
 
469 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  26.21 
 
 
659 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  25.27 
 
 
648 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  26.52 
 
 
500 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  24.52 
 
 
708 aa  60.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  24.29 
 
 
619 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  22.74 
 
 
777 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  24.36 
 
 
616 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  24.76 
 
 
616 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  25.82 
 
 
617 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  22.9 
 
 
621 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  27.58 
 
 
534 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  25.71 
 
 
473 aa  58.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.46 
 
 
702 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  24.05 
 
 
616 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  20.33 
 
 
369 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  28.32 
 
 
523 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  22.17 
 
 
541 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.51 
 
 
540 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  29.2 
 
 
523 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  25.49 
 
 
474 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  37.8 
 
 
492 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  23.87 
 
 
573 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  20.4 
 
 
558 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  22.99 
 
 
514 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  19.84 
 
 
564 aa  43.5  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>