69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2674 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1133    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  52.36 
 
 		 534 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  45.97 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  47.07 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  47.05 
 
 		 520 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  45.92 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  43.18 
 
 		 550 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  44.59 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  43.47 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  45.06 
 
 		 561 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  39.72 
 
 		 636 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  42.88 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  41.62 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  42.76 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  43.51 
 
 		 546 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  40.03 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  40.03 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  40.03 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  40.59 
 
 		 577 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  40.57 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  41.52 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  42.88 
 
 		 568 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  28.43 
 
 		 626 aa  88.2  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  27.67 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  28.78 
 
 		 632 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  30.96 
 
 		 671 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  31.43 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.09 
 
 		 661 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  28.81 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  29.14 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  29.14 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  29.47 
 
 		 633 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  26.04 
 
 		 622 aa  80.1  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  26.18 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  28.42 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  29.39 
 
 		 650 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  30.07 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  26.55 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  29.3 
 
 		 668 aa  77.4  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  26.58 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  26.67 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  26.33 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  28.62 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  25.91 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  25.91 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  28.62 
 
 		 616 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  28.27 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  24.73 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  26.73 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  29.89 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  26.79 
 
 		 708 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  28.76 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  27.02 
 
 		 619 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  29.01 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  28.11 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.68 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  25.96 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  24.22 
 
 		 616 aa  57  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.74 
 
 		 702 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  23.86 
 
 		 706 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  23.55 
 
 		 773 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  39.53 
 
 		 492 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  26.61 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  26.38 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  21.14 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  32.97 
 
 		 621 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  20.67 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  24.29 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.85 
 
 		 469 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>