64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4633 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  68.27 
 
 
616 aa  864    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  68.64 
 
 
477 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  69.17 
 
 
619 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  66.56 
 
 
648 aa  856    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  69.77 
 
 
617 aa  878    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  67.92 
 
 
668 aa  869    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  62.74 
 
 
650 aa  767    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  68.97 
 
 
616 aa  869    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  100 
 
 
639 aa  1307    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  52.57 
 
 
632 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  71.52 
 
 
670 aa  934    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  72.27 
 
 
671 aa  953    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  66.19 
 
 
659 aa  825    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  48.8 
 
 
655 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  50.16 
 
 
628 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  48.24 
 
 
649 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  45.87 
 
 
648 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  50.16 
 
 
626 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  44.41 
 
 
646 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  49.92 
 
 
623 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  49.92 
 
 
628 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  49.92 
 
 
628 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  48.39 
 
 
661 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  49.03 
 
 
633 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  46.03 
 
 
714 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  49.59 
 
 
616 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  43.44 
 
 
622 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  48.52 
 
 
615 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  49.26 
 
 
616 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  43.85 
 
 
708 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  48.36 
 
 
615 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  50.44 
 
 
577 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 
370 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  28.7 
 
 
616 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  29.81 
 
 
678 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  28.17 
 
 
773 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  31.07 
 
 
706 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  29.66 
 
 
621 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  41.03 
 
 
233 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  27.89 
 
 
777 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  49.32 
 
 
154 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  31.43 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  27.3 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  28.32 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  28.36 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  27.59 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  27.68 
 
 
590 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  26.45 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  26.94 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  27.46 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  27.81 
 
 
520 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  27.6 
 
 
540 aa  64.3  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  25.32 
 
 
569 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  25.32 
 
 
569 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  25.32 
 
 
569 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  28.14 
 
 
531 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  28.42 
 
 
542 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  25.98 
 
 
577 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  23.22 
 
 
540 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  22.38 
 
 
552 aa  57  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  42.59 
 
 
561 aa  50.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.79 
 
 
702 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  34.62 
 
 
636 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  28.46 
 
 
568 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>