63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0959 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  49.28 
 
 
773 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  100 
 
 
777 aa  1605    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  30.57 
 
 
706 aa  228  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  27.9 
 
 
655 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  27.98 
 
 
622 aa  184  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  28.23 
 
 
659 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  29.39 
 
 
628 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  29.54 
 
 
708 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  27.04 
 
 
661 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  28.03 
 
 
649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  29.34 
 
 
628 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  28.43 
 
 
628 aa  181  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  29.02 
 
 
633 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  27.88 
 
 
632 aa  176  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  26.92 
 
 
616 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  28.16 
 
 
616 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  29.12 
 
 
615 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  27.56 
 
 
668 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  28.1 
 
 
639 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  28.13 
 
 
616 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  29.12 
 
 
615 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  27.73 
 
 
671 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  26.81 
 
 
617 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  28.16 
 
 
616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  27.4 
 
 
623 aa  168  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  27.26 
 
 
626 aa  167  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  27.89 
 
 
648 aa  167  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  28.21 
 
 
616 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  27.87 
 
 
619 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  27.57 
 
 
650 aa  164  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  30.99 
 
 
577 aa  162  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  26.54 
 
 
670 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  28.54 
 
 
714 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  25.04 
 
 
646 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  25.2 
 
 
678 aa  147  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  24.92 
 
 
648 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  25.45 
 
 
621 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  29.45 
 
 
477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  30.29 
 
 
370 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  20.74 
 
 
559 aa  65.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  31.58 
 
 
154 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  19.82 
 
 
550 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  22.11 
 
 
542 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  22.18 
 
 
534 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3133  hypothetical protein  37.76 
 
 
118 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.64 
 
 
520 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  24.51 
 
 
540 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  21.33 
 
 
569 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  21.33 
 
 
569 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  21.33 
 
 
569 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  22.56 
 
 
535 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  28.88 
 
 
233 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  21.51 
 
 
552 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  24.05 
 
 
531 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  22.66 
 
 
566 aa  51.6  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  37.68 
 
 
546 aa  51.2  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  34.25 
 
 
540 aa  48.5  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  26.73 
 
 
561 aa  48.9  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  25.39 
 
 
568 aa  48.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  31.17 
 
 
590 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  29.73 
 
 
469 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  27.59 
 
 
636 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  30.86 
 
 
577 aa  44.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>