82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3791 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  69.19 
 
 
569 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  67.34 
 
 
540 aa  716    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  80.56 
 
 
542 aa  886    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  69.19 
 
 
569 aa  751    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  69.19 
 
 
569 aa  751    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1091    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  52.8 
 
 
531 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  46.8 
 
 
559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  46.88 
 
 
552 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  49.08 
 
 
534 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  47.3 
 
 
548 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  45.6 
 
 
577 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  46.81 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  45.04 
 
 
535 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  45.11 
 
 
546 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  42.76 
 
 
565 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  43.61 
 
 
550 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  43.49 
 
 
566 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  44.08 
 
 
561 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  39.75 
 
 
636 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  43.5 
 
 
520 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  40.86 
 
 
568 aa  306  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  27.95 
 
 
678 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.72 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  25.93 
 
 
615 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  25.93 
 
 
615 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  26.52 
 
 
714 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  28.38 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  26.05 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  26.01 
 
 
633 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  26.05 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  25.72 
 
 
616 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  26.09 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  26.09 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  28.35 
 
 
621 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  26.27 
 
 
616 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.03 
 
 
661 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  26.42 
 
 
626 aa  66.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  26.01 
 
 
577 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  23.31 
 
 
460 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  26.73 
 
 
649 aa  63.9  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.2 
 
 
469 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  25.17 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  24.91 
 
 
622 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  23.58 
 
 
619 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  26.18 
 
 
650 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  24.83 
 
 
648 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  23.22 
 
 
639 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  25.59 
 
 
628 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.23 
 
 
702 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  25.63 
 
 
632 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  24.4 
 
 
706 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  24.51 
 
 
777 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  26.55 
 
 
648 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  26.33 
 
 
668 aa  57.4  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  23.75 
 
 
773 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  38.71 
 
 
492 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  26.72 
 
 
617 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  23.01 
 
 
616 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  34.72 
 
 
708 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  25 
 
 
670 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  26.06 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  26.69 
 
 
616 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  37.1 
 
 
646 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  23.69 
 
 
616 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  24.68 
 
 
671 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  26.91 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  28.11 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  26.91 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  25.57 
 
 
659 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  23 
 
 
574 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 
558 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  24.56 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  31.4 
 
 
541 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  25 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  25.13 
 
 
674 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  22.66 
 
 
622 aa  45.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  24.41 
 
 
655 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  27.4 
 
 
710 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  30.97 
 
 
445 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  34.07 
 
 
474 aa  43.5  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  30.52 
 
 
447 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>