101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0461 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  100 
 
 
469 aa  977    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  37.61 
 
 
460 aa  269  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  34.55 
 
 
489 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  34.55 
 
 
489 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  33.94 
 
 
475 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  32.65 
 
 
702 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  22.97 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11069  alkaline phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03860)  25.75 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.43 
 
 
727 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  25.21 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  23.52 
 
 
540 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.17 
 
 
471 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.65 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  22.2 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  23.39 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  23.39 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  23.39 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.63 
 
 
637 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  22.72 
 
 
566 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  26.39 
 
 
558 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  22.34 
 
 
550 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.55 
 
 
585 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  24.13 
 
 
535 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  24.61 
 
 
542 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  24.03 
 
 
523 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  25.78 
 
 
558 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  26.42 
 
 
529 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.94 
 
 
458 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  30.23 
 
 
532 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  23.79 
 
 
523 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  23.66 
 
 
546 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  23.36 
 
 
534 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  27.38 
 
 
559 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  28.23 
 
 
516 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.99 
 
 
573 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  26.44 
 
 
523 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  26.74 
 
 
561 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  23.85 
 
 
520 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  22.73 
 
 
546 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  26.45 
 
 
552 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  24.26 
 
 
523 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  25 
 
 
529 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  25 
 
 
531 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.73 
 
 
573 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.73 
 
 
440 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  23.62 
 
 
623 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  28 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  23.76 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  23.64 
 
 
530 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.59 
 
 
587 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  25.93 
 
 
633 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  25.74 
 
 
577 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  38.98 
 
 
678 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  28.42 
 
 
522 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  23.74 
 
 
706 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  27.42 
 
 
523 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  26.56 
 
 
519 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.44 
 
 
552 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  26.67 
 
 
530 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 
530 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  35.37 
 
 
534 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  28.98 
 
 
590 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  21.19 
 
 
531 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  23.53 
 
 
538 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  24.48 
 
 
549 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  25.29 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  31.11 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.91 
 
 
661 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.42 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  23.81 
 
 
511 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  24.78 
 
 
528 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  24.82 
 
 
618 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  21.52 
 
 
616 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  28.7 
 
 
636 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  34.15 
 
 
534 aa  47  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  25.2 
 
 
513 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  25.52 
 
 
615 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  23.89 
 
 
545 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  25.52 
 
 
615 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  29.73 
 
 
777 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.29 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  24.12 
 
 
483 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  24.07 
 
 
494 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  31.87 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  25.33 
 
 
539 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  25 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  23.5 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  23.87 
 
 
555 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  25.34 
 
 
577 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.89 
 
 
524 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  22.37 
 
 
541 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  23.79 
 
 
514 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  25.35 
 
 
538 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  28.57 
 
 
674 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  24.2 
 
 
522 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  23.87 
 
 
515 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  25.61 
 
 
518 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  28.95 
 
 
548 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  24.85 
 
 
565 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  22.48 
 
 
519 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>