78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5893 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  39.61 
 
 
370 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  44.22 
 
 
369 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  32.71 
 
 
507 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  31.3 
 
 
440 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  31.33 
 
 
433 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  30.36 
 
 
530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  30.8 
 
 
637 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.98 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45174  predicted protein  27.45 
 
 
473 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.97 
 
 
471 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  27.59 
 
 
440 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.51 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.87 
 
 
727 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  24.18 
 
 
494 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  25.26 
 
 
529 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  25.63 
 
 
534 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  22.46 
 
 
534 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.32 
 
 
585 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  24.03 
 
 
558 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  22.46 
 
 
534 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  23.97 
 
 
529 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  22.64 
 
 
523 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  23.13 
 
 
539 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  22.92 
 
 
531 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4485  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.33 
 
 
453 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133159  normal  0.0285057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  24.03 
 
 
549 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  24.05 
 
 
522 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  24.77 
 
 
674 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  22.3 
 
 
539 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  21.79 
 
 
555 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  22.98 
 
 
587 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  23.28 
 
 
514 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  21.89 
 
 
523 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  22.29 
 
 
531 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  21.53 
 
 
520 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  24.66 
 
 
513 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  21.93 
 
 
539 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  23.11 
 
 
530 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  22.22 
 
 
516 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.37 
 
 
524 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  25.95 
 
 
522 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  22.64 
 
 
529 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  22.93 
 
 
532 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  27.73 
 
 
523 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  31.11 
 
 
469 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  22.22 
 
 
538 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.23 
 
 
1298 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  21.92 
 
 
516 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  24.21 
 
 
520 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  24.49 
 
 
538 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  25 
 
 
519 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  22.86 
 
 
559 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  21.86 
 
 
544 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  23.97 
 
 
528 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  23.85 
 
 
489 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  21.4 
 
 
540 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  23.85 
 
 
489 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  24.88 
 
 
531 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  21.74 
 
 
524 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  24.34 
 
 
529 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  23.25 
 
 
525 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  20.89 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  21.24 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  21.33 
 
 
550 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.65 
 
 
573 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  23.14 
 
 
523 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  23.11 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  25.51 
 
 
527 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  23.14 
 
 
523 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  20.59 
 
 
518 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  21.31 
 
 
511 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  22.91 
 
 
532 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  22.91 
 
 
546 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  23.44 
 
 
517 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  21.58 
 
 
541 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  27.59 
 
 
524 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  22.12 
 
 
523 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>