144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1326 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  100 
 
 
538 aa  1100    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  48.41 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  48.41 
 
 
534 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  47.79 
 
 
544 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  46.26 
 
 
529 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  43.73 
 
 
522 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  43.53 
 
 
530 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  48.56 
 
 
529 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  46.02 
 
 
524 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  41.99 
 
 
555 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  41.71 
 
 
534 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  45.17 
 
 
523 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  43.15 
 
 
523 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  44.57 
 
 
549 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  42.56 
 
 
523 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  41.1 
 
 
530 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  43.61 
 
 
516 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  40.25 
 
 
563 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  43.87 
 
 
513 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  41.61 
 
 
531 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  43.12 
 
 
511 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.46 
 
 
524 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  44.05 
 
 
558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  41.92 
 
 
535 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  40.7 
 
 
521 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  40.62 
 
 
529 aa  353  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  39.59 
 
 
528 aa  349  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  39.19 
 
 
528 aa  346  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  39.06 
 
 
530 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  39.85 
 
 
529 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  40.26 
 
 
529 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  40.89 
 
 
545 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  40.44 
 
 
523 aa  333  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  40.12 
 
 
525 aa  333  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  40 
 
 
494 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  40.68 
 
 
538 aa  332  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  41.24 
 
 
540 aa  332  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  41.67 
 
 
523 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  38.52 
 
 
538 aa  329  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  41.65 
 
 
522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  39.44 
 
 
552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  37.19 
 
 
531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  41.13 
 
 
502 aa  312  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  39.81 
 
 
519 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  39.47 
 
 
554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  36.92 
 
 
531 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
515 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  39.07 
 
 
618 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  37.11 
 
 
520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.35 
 
 
555 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  37.94 
 
 
521 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  34.63 
 
 
540 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  35.93 
 
 
540 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  32.75 
 
 
587 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  33.98 
 
 
541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  33.92 
 
 
541 aa  243  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  34.62 
 
 
523 aa  240  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  34.59 
 
 
550 aa  240  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  32.27 
 
 
617 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  32.27 
 
 
606 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33.21 
 
 
532 aa  224  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  30.44 
 
 
557 aa  220  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  30.37 
 
 
641 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  30.23 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  30.72 
 
 
557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.14 
 
 
564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  30.87 
 
 
574 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  30.63 
 
 
576 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  29.39 
 
 
622 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  31.17 
 
 
583 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  30.29 
 
 
575 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  27.21 
 
 
674 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  30.42 
 
 
582 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  31.05 
 
 
596 aa  203  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  28.9 
 
 
589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  29.32 
 
 
588 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
588 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  29.04 
 
 
588 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  29.04 
 
 
588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  28 
 
 
589 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  35.8 
 
 
585 aa  193  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  34.23 
 
 
600 aa  187  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  36.17 
 
 
587 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  34.39 
 
 
588 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  29.12 
 
 
450 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 
588 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 
588 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  36.94 
 
 
589 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  33.09 
 
 
590 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
566 aa  180  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  36.97 
 
 
587 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  36.17 
 
 
588 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  34.31 
 
 
679 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.03 
 
 
714 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  54.14 
 
 
209 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  27.65 
 
 
710 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  31.69 
 
 
670 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.4 
 
 
689 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  28.09 
 
 
545 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.61 
 
 
585 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>