18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45959 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  100 
 
 
507 aa  1056    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  32.71 
 
 
340 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  29.5 
 
 
370 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  30.7 
 
 
369 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  28.19 
 
 
440 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  27.63 
 
 
530 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25 
 
 
637 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  26.93 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.22 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.05 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.1 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45174  predicted protein  22.77 
 
 
473 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  28.36 
 
 
534 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.69 
 
 
475 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4485  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.59 
 
 
453 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133159  normal  0.0285057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  24.81 
 
 
534 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  27.64 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  24.48 
 
 
544 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>