60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0226 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  100 
 
 
471 aa  979    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  45.83 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  31.46 
 
 
637 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  26.97 
 
 
340 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  25.83 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.61 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  25.3 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  23.3 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2305  hypothetical protein  39.32 
 
 
131 aa  74.7  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.62 
 
 
727 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1948  hypothetical protein  41.12 
 
 
120 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  26.26 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  25.1 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.17 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  23.32 
 
 
532 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  23.19 
 
 
523 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  22.45 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  26.28 
 
 
516 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  22.95 
 
 
514 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  30 
 
 
528 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  22.89 
 
 
523 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  25.75 
 
 
519 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  21.37 
 
 
1298 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  25.19 
 
 
636 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  21.96 
 
 
555 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  23.31 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  25.42 
 
 
520 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.94 
 
 
702 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  21.33 
 
 
539 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  21.54 
 
 
530 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  21.39 
 
 
516 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.12 
 
 
555 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  20.64 
 
 
520 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.48 
 
 
475 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  22.82 
 
 
539 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  23.91 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  23.64 
 
 
561 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  23.1 
 
 
549 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  22.98 
 
 
567 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  22.77 
 
 
523 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.42 
 
 
585 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  22.73 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  23.78 
 
 
559 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  23.14 
 
 
523 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  20.29 
 
 
528 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  23.19 
 
 
530 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  23.06 
 
 
532 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  20.81 
 
 
552 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  20.28 
 
 
558 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  23.43 
 
 
521 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  20.83 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  22.33 
 
 
539 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  24.03 
 
 
541 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  20.93 
 
 
531 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4485  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.54 
 
 
453 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133159  normal  0.0285057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  22.8 
 
 
559 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.53 
 
 
518 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  22.79 
 
 
558 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  23.67 
 
 
573 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  23.75 
 
 
534 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>