151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1561 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  100 
 
 
541 aa  1104    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  53.8 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  48.96 
 
 
513 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  50.89 
 
 
520 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  51.02 
 
 
518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  50 
 
 
520 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  47.69 
 
 
520 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  50.41 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  48.13 
 
 
573 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  48.88 
 
 
517 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  45.97 
 
 
527 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  45.97 
 
 
527 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  44.76 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  47.49 
 
 
523 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  48.88 
 
 
483 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  47.01 
 
 
523 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  47.44 
 
 
519 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  46.91 
 
 
567 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  47.14 
 
 
528 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  44.96 
 
 
522 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  42.57 
 
 
526 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  44.11 
 
 
532 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  45.24 
 
 
526 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  42.96 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  42.38 
 
 
539 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  42.94 
 
 
539 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  43.39 
 
 
539 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  42.8 
 
 
546 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.25 
 
 
547 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  41.24 
 
 
520 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  39.3 
 
 
559 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.79 
 
 
727 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.72 
 
 
587 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.22 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  29.46 
 
 
519 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  31.84 
 
 
549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  28.41 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  27.01 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  29.09 
 
 
523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  28.26 
 
 
531 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  27.29 
 
 
541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.67 
 
 
564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  27.9 
 
 
540 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  40.68 
 
 
191 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  28.01 
 
 
538 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  28.25 
 
 
541 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.42 
 
 
555 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  29.02 
 
 
513 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  31.44 
 
 
545 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
600 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  27 
 
 
540 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.94 
 
 
552 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.66 
 
 
524 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 
530 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
511 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  29.58 
 
 
523 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  24.55 
 
 
528 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  25.19 
 
 
557 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  27.79 
 
 
528 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  27.92 
 
 
520 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  28.4 
 
 
530 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  25.93 
 
 
576 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  28.84 
 
 
523 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  26.2 
 
 
529 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  28.47 
 
 
583 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.91 
 
 
516 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 
521 aa  97.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  26.45 
 
 
532 aa  97.8  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.84 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  26.07 
 
 
529 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  30.27 
 
 
535 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  25.61 
 
 
522 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  26.89 
 
 
531 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  24.19 
 
 
557 aa  94.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  26.86 
 
 
534 aa  94.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  25.48 
 
 
674 aa  94  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  25.7 
 
 
450 aa  93.6  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  26.38 
 
 
590 aa  93.6  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  25.65 
 
 
589 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  26.03 
 
 
588 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  25.55 
 
 
588 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  27.02 
 
 
531 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  25.79 
 
 
588 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  25.55 
 
 
679 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  25.79 
 
 
588 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  24.82 
 
 
589 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  26.44 
 
 
523 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  25.77 
 
 
538 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  28.1 
 
 
618 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
588 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  25.91 
 
 
588 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.22 
 
 
529 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
588 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  26.35 
 
 
522 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
585 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  26.56 
 
 
494 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  25.96 
 
 
530 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  24.33 
 
 
589 aa  87.8  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  26.12 
 
 
574 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>