141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2613 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  61.06 
 
 
670 aa  818    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  100 
 
 
679 aa  1393    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  32.8 
 
 
714 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  30.33 
 
 
710 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  29.49 
 
 
576 aa  228  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  30.74 
 
 
589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  30.17 
 
 
606 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  30.17 
 
 
617 aa  224  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  30.17 
 
 
589 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
588 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  28.51 
 
 
589 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  44.06 
 
 
744 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  28.94 
 
 
588 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  29.56 
 
 
557 aa  217  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  29.9 
 
 
583 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  30.08 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  28.79 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  28.79 
 
 
588 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  28.64 
 
 
588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  29.68 
 
 
588 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  29.48 
 
 
550 aa  215  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  28.51 
 
 
590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.47 
 
 
564 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  29.16 
 
 
596 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  35.81 
 
 
540 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 
585 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  29.12 
 
 
588 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  36.93 
 
 
540 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  29.73 
 
 
587 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  35.01 
 
 
529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  34.73 
 
 
530 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 
587 aa  200  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
589 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  29.68 
 
 
557 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  31.47 
 
 
600 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.81 
 
 
555 aa  196  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  32.63 
 
 
531 aa  194  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.21 
 
 
524 aa  193  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.98 
 
 
587 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  39.6 
 
 
530 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  33.51 
 
 
513 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.55 
 
 
689 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  30.9 
 
 
522 aa  187  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33.42 
 
 
532 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  29.64 
 
 
582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  32.13 
 
 
575 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  33.86 
 
 
538 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  32.9 
 
 
521 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  26.21 
 
 
523 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  30.96 
 
 
674 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  32.53 
 
 
522 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  33.69 
 
 
523 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  36.05 
 
 
538 aa  178  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  30.52 
 
 
523 aa  177  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  32.71 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  27.84 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  32.45 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  29.71 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  31.52 
 
 
528 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
541 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  33.79 
 
 
534 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  30.96 
 
 
530 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  31.61 
 
 
545 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  27.1 
 
 
622 aa  170  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  32.74 
 
 
555 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  30.24 
 
 
563 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  37.5 
 
 
534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  31.22 
 
 
494 aa  168  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  33.99 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  36.48 
 
 
554 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  32.72 
 
 
549 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  32.23 
 
 
544 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  34.44 
 
 
511 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  30.42 
 
 
531 aa  160  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  33.99 
 
 
520 aa  160  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  31.72 
 
 
531 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 
535 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  30.19 
 
 
618 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  30.56 
 
 
516 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  30.16 
 
 
534 aa  156  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  29.89 
 
 
519 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  30.54 
 
 
528 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  33.12 
 
 
529 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  28.36 
 
 
525 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  28.81 
 
 
529 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
523 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  27.72 
 
 
641 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.53 
 
 
552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  30.87 
 
 
523 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  32.89 
 
 
502 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  30.1 
 
 
529 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.29 
 
 
540 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.41 
 
 
524 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  29.44 
 
 
523 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  29.81 
 
 
515 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
566 aa  142  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  30.62 
 
 
558 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 
521 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  28.8 
 
 
539 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  24.65 
 
 
791 aa  117  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>