141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4636 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  62.48 
 
 
524 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  100 
 
 
523 aa  1070    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  62.86 
 
 
522 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  58.59 
 
 
526 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  55.53 
 
 
520 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  52.76 
 
 
532 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  53.92 
 
 
520 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  50.28 
 
 
539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  51.81 
 
 
516 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  53.97 
 
 
520 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  54.18 
 
 
517 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  51.74 
 
 
539 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  49.53 
 
 
526 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  55.01 
 
 
523 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  52.35 
 
 
573 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  51.5 
 
 
528 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  50.48 
 
 
527 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  50.96 
 
 
513 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  50.48 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  55.21 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  53.55 
 
 
518 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  51.83 
 
 
519 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  51.87 
 
 
567 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  48.31 
 
 
539 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  51.68 
 
 
519 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  49.3 
 
 
514 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  51.41 
 
 
520 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  47.31 
 
 
541 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  46.65 
 
 
546 aa  432  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  47.14 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  44.18 
 
 
559 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.79 
 
 
555 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  28.25 
 
 
727 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  32.47 
 
 
555 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  30.88 
 
 
538 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  30.13 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  32.01 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.09 
 
 
552 aa  126  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  29.68 
 
 
531 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  45.58 
 
 
191 aa  124  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  29.84 
 
 
563 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  27.96 
 
 
573 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.2 
 
 
573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  27.45 
 
 
530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  29.72 
 
 
516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  29.12 
 
 
596 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  29.41 
 
 
529 aa  120  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  28.45 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  28.35 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  28.45 
 
 
587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  27.86 
 
 
521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  28.04 
 
 
540 aa  114  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  28.09 
 
 
550 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  29.3 
 
 
519 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  26.55 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  27.29 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  28.6 
 
 
545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  27.4 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.01 
 
 
564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  29.07 
 
 
540 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  28.64 
 
 
576 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  29.18 
 
 
600 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  28.37 
 
 
523 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
535 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  29.18 
 
 
523 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.7 
 
 
540 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.07 
 
 
554 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  29.17 
 
 
606 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  29.17 
 
 
617 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  27.85 
 
 
541 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  30.3 
 
 
549 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  26.88 
 
 
529 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  28.19 
 
 
538 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  28 
 
 
523 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  30.24 
 
 
523 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 
530 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  27.65 
 
 
531 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  29.11 
 
 
618 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  27.6 
 
 
583 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.7 
 
 
524 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  30.22 
 
 
513 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  28.83 
 
 
532 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  27.33 
 
 
541 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
670 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.42 
 
 
585 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  30.68 
 
 
520 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  26.54 
 
 
589 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  28.04 
 
 
588 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.04 
 
 
588 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  27.04 
 
 
679 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  26.76 
 
 
494 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  28.63 
 
 
528 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  27.79 
 
 
588 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  26.24 
 
 
589 aa  97.8  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  28.24 
 
 
557 aa  97.8  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  27.21 
 
 
588 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  26.91 
 
 
531 aa  97.4  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  27.64 
 
 
523 aa  97.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  28.47 
 
 
529 aa  97.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
588 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>