139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3587 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  89.78 
 
 
588 aa  1042    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  74.45 
 
 
585 aa  917    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  91.82 
 
 
588 aa  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  91.82 
 
 
588 aa  1091    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  77.17 
 
 
587 aa  910    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  92.67 
 
 
588 aa  1103    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  77.59 
 
 
589 aa  936    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  99.32 
 
 
588 aa  1204    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  74.66 
 
 
590 aa  885    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  90.97 
 
 
587 aa  1033    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  99.49 
 
 
588 aa  1205    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  71.77 
 
 
589 aa  889    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  71.87 
 
 
589 aa  869    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  99.32 
 
 
588 aa  1205    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  73.98 
 
 
589 aa  851    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  100 
 
 
588 aa  1211    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  53.69 
 
 
576 aa  615  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  52.58 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  52.85 
 
 
606 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  52.3 
 
 
583 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  47.85 
 
 
564 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  47.99 
 
 
557 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  46.03 
 
 
557 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  47.21 
 
 
596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  43.14 
 
 
600 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  40.61 
 
 
582 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  39.44 
 
 
574 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  35.91 
 
 
566 aa  337  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35 
 
 
555 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  33.44 
 
 
587 aa  326  9e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  35.1 
 
 
674 aa  324  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  50.15 
 
 
622 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  37.26 
 
 
550 aa  316  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  36.82 
 
 
523 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  34.08 
 
 
540 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  34.89 
 
 
540 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  33.45 
 
 
541 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  32.58 
 
 
541 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  32.94 
 
 
511 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  30.83 
 
 
528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  32.85 
 
 
523 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  33.57 
 
 
516 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  32.99 
 
 
641 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  31.85 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  30.33 
 
 
529 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  31.97 
 
 
521 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.97 
 
 
540 aa  226  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  29.52 
 
 
522 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  30.78 
 
 
535 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  30.93 
 
 
530 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  29.82 
 
 
791 aa  221  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  37.08 
 
 
538 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  29.87 
 
 
531 aa  220  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  32.85 
 
 
554 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  29.63 
 
 
502 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
530 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  28.64 
 
 
679 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  30.4 
 
 
531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  30.84 
 
 
530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  28.15 
 
 
534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  36.67 
 
 
522 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  31.18 
 
 
545 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.31 
 
 
552 aa  210  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  29.57 
 
 
523 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  30.87 
 
 
528 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  29.26 
 
 
519 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  32.2 
 
 
618 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  28.55 
 
 
523 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  29.81 
 
 
538 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.36 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  37.25 
 
 
523 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 
670 aa  200  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  34.63 
 
 
555 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  36.36 
 
 
531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  28.97 
 
 
538 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  35.81 
 
 
523 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  36.81 
 
 
529 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  36.01 
 
 
534 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  35.79 
 
 
534 aa  193  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  30.23 
 
 
563 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  35.71 
 
 
549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  28.03 
 
 
529 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  30.89 
 
 
532 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  30.69 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  32.95 
 
 
494 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  29.05 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  28.82 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  35.03 
 
 
558 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  32.29 
 
 
515 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  29.61 
 
 
575 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.07 
 
 
714 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.06 
 
 
524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  26.69 
 
 
521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  31.78 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  29.94 
 
 
529 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  28.11 
 
 
450 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  28.17 
 
 
710 aa  151  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  31.13 
 
 
744 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.32 
 
 
689 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  28.72 
 
 
539 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>