143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0946 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  100 
 
 		 525 aa  1062    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  55.03 
 
 		 524 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  42.52 
 
 		 529 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  40.34 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  40.9 
 
 		 530 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  43.33 
 
 		 513 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  43.43 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  42.83 
 
 		 534 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  41.67 
 
 		 544 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  39.81 
 
 		 530 aa  350  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  43.12 
 
 		 549 aa  340  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  41.61 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  41.1 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  42.37 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  39.4 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  41.14 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  38.59 
 
 		 531 aa  326  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  40.24 
 
 		 523 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  39.47 
 
 		 563 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  37.08 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  40.45 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  39.43 
 
 		 524 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  39.1 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  41.44 
 
 		 523 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  35.52 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  38.6 
 
 		 535 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  38.22 
 
 		 531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  40.41 
 
 		 523 aa  303  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  37.55 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  40.12 
 
 		 540 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  43.23 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  37.73 
 
 		 538 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  36.86 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  38.89 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  37.9 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  39.67 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  38.15 
 
 		 522 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  38.63 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  37.17 
 
 		 558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  39.14 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  39.71 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  35.48 
 
 		 521 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  39.36 
 
 		 618 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  35.57 
 
 		 515 aa  279  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  35.86 
 
 		 519 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  40.1 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  36.45 
 
 		 552 aa  272  9e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  37.38 
 
 		 520 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.8 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  35.31 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  33.2 
 
 		 550 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  35.37 
 
 		 541 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  34.71 
 
 		 540 aa  238  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  35.06 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  33.84 
 
 		 540 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  32.99 
 
 		 587 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  32.82 
 
 		 523 aa  220  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  29.88 
 
 		 674 aa  215  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.27 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  30.63 
 
 		 576 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  28.93 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  31.72 
 
 		 575 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 588 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 588 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  28.62 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  31.67 
 
 		 606 aa  183  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  31.67 
 
 		 617 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  31.87 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  29.17 
 
 		 588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  28.96 
 
 		 641 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  29.17 
 
 		 588 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  29.23 
 
 		 588 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  29.05 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  29.77 
 
 		 589 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  30.12 
 
 		 583 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  31.04 
 
 		 590 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  36.14 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  28.87 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 		 585 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  34.65 
 
 		 588 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  27.47 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  28.29 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.15 
 
 		 714 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  31.47 
 
 		 600 aa  160  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  29.69 
 
 		 566 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  31.73 
 
 		 589 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  33.52 
 
 		 587 aa  156  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  32.39 
 
 		 589 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  26.63 
 
 		 710 aa  153  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  29.14 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  29.45 
 
 		 589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  28.8 
 
 		 679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  32.95 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 670 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  50.67 
 
 		 209 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.05 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.46 
 
 		 689 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  25.62 
 
 		 545 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>