151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1673 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  100 
 
 
524 aa  1065    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  57.66 
 
 
521 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  56.65 
 
 
528 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  53.85 
 
 
555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  51.04 
 
 
530 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  49.24 
 
 
522 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  52.52 
 
 
511 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  51.15 
 
 
516 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  52.7 
 
 
523 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  47.7 
 
 
530 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  53.65 
 
 
523 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  49.05 
 
 
529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  51.06 
 
 
522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  49.62 
 
 
563 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  47.99 
 
 
528 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  48.77 
 
 
538 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  48.77 
 
 
530 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  50.5 
 
 
549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  49.33 
 
 
552 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  47.71 
 
 
531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  46.37 
 
 
529 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  48.17 
 
 
523 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  43.88 
 
 
534 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  47.14 
 
 
545 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  45.65 
 
 
535 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  45.32 
 
 
529 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  43.79 
 
 
538 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  46.25 
 
 
540 aa  402  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  44.71 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  49.17 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  48.02 
 
 
502 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  44.57 
 
 
519 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  45.28 
 
 
515 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  43.67 
 
 
523 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  43.69 
 
 
523 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  44.79 
 
 
520 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  42.17 
 
 
531 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  46.4 
 
 
558 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  41.9 
 
 
531 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  44.47 
 
 
513 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  43.16 
 
 
529 aa  363  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  40.86 
 
 
521 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  43.28 
 
 
534 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  42.72 
 
 
534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  43.52 
 
 
618 aa  340  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  41.62 
 
 
554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  40.91 
 
 
544 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  40.25 
 
 
525 aa  324  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  39.66 
 
 
524 aa  320  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  43.35 
 
 
529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  38.16 
 
 
555 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  38.05 
 
 
540 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  36.63 
 
 
587 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  38.18 
 
 
541 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  37.23 
 
 
540 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  37.41 
 
 
541 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  38.02 
 
 
532 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  36.4 
 
 
550 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  35.74 
 
 
576 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  33.96 
 
 
583 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  32.48 
 
 
674 aa  240  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  33.97 
 
 
606 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  33.97 
 
 
617 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  36.71 
 
 
523 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  32.92 
 
 
575 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  35.58 
 
 
596 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  32.09 
 
 
588 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 
588 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  34.5 
 
 
587 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 
588 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.81 
 
 
564 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 
585 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  31.7 
 
 
641 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  30.53 
 
 
588 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  30.49 
 
 
588 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  30.49 
 
 
588 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  37.53 
 
 
589 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  30.19 
 
 
588 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  35.99 
 
 
590 aa  210  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  31.17 
 
 
557 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  30.79 
 
 
600 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  33.68 
 
 
574 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  33.1 
 
 
679 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  30.4 
 
 
589 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  30.54 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  32.36 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  36.25 
 
 
589 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  30.67 
 
 
582 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  30.86 
 
 
450 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  36.72 
 
 
588 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  30.12 
 
 
710 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  33.22 
 
 
566 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  36.09 
 
 
587 aa  177  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  32.45 
 
 
670 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  39.94 
 
 
622 aa  174  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  29.83 
 
 
545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.24 
 
 
714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.26 
 
 
689 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  49.33 
 
 
209 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  32.59 
 
 
744 aa  144  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>