140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0092 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  63.1 
 
 
534 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  62.5 
 
 
534 aa  197  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  66.01 
 
 
529 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  64.34 
 
 
544 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  54.09 
 
 
538 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  50.29 
 
 
555 aa  148  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  46.62 
 
 
534 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  49.33 
 
 
524 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  53.1 
 
 
545 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  52.48 
 
 
535 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  49.66 
 
 
528 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  51.19 
 
 
549 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  47.59 
 
 
521 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  50.67 
 
 
525 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  48.92 
 
 
530 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  47.27 
 
 
494 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  52.82 
 
 
529 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  46.04 
 
 
522 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  47.48 
 
 
530 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  50.35 
 
 
540 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  48.3 
 
 
531 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  46.15 
 
 
519 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  43.36 
 
 
530 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  47.62 
 
 
538 aa  131  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  55.71 
 
 
513 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  46.63 
 
 
528 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  48.95 
 
 
511 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  39 
 
 
554 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  47.26 
 
 
529 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  49.32 
 
 
529 aa  127  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  48.23 
 
 
529 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  49.3 
 
 
555 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  47.55 
 
 
563 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  49.66 
 
 
523 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  48.23 
 
 
523 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  44.38 
 
 
523 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  48.3 
 
 
516 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  50.34 
 
 
523 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  50.35 
 
 
524 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  45.89 
 
 
531 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  47.37 
 
 
515 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  47.37 
 
 
521 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  47.89 
 
 
618 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  44.37 
 
 
502 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  44.22 
 
 
552 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  47.97 
 
 
520 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  42.76 
 
 
538 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  45.07 
 
 
558 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  45.39 
 
 
523 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  46.1 
 
 
522 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  45.11 
 
 
540 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  44.83 
 
 
587 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  45.45 
 
 
540 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  39.26 
 
 
670 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  40.15 
 
 
596 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  45.86 
 
 
523 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  45.04 
 
 
531 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  34.07 
 
 
679 aa  94.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  39.75 
 
 
541 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  95.92 
 
 
125 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  89.09 
 
 
563 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  38.31 
 
 
541 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  40.3 
 
 
710 aa  92.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  36.36 
 
 
575 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  40.46 
 
 
622 aa  91.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  44.88 
 
 
550 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  37.31 
 
 
587 aa  88.2  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  36.57 
 
 
588 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  35.82 
 
 
588 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  35.82 
 
 
588 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  40.32 
 
 
606 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  34.85 
 
 
674 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  40.32 
 
 
617 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  35.07 
 
 
588 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  35.07 
 
 
588 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  38.57 
 
 
532 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  35.82 
 
 
589 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  35.07 
 
 
588 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 
588 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 
588 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  39.55 
 
 
583 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  35.07 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  32.84 
 
 
590 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  35.77 
 
 
576 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  30.71 
 
 
557 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  27.41 
 
 
450 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  36.03 
 
 
585 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  36.8 
 
 
600 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  33.6 
 
 
587 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  33.58 
 
 
589 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  38.69 
 
 
574 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  32.06 
 
 
714 aa  74.7  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  34.75 
 
 
744 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  29.13 
 
 
557 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
589 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.66 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.08 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.77 
 
 
689 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  91.89 
 
 
522 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>