80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4021 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1121    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  51 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  49.06 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  46.8 
 
 		 540 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  47.22 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  45.42 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  46.1 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  46.1 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  46.1 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  45.4 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  47.48 
 
 		 540 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  44.65 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  45.42 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  43.44 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  43.47 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  48.53 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  46.54 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  45.63 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  43.79 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  39.03 
 
 		 636 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  42.59 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  42.75 
 
 		 568 aa  349  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  25.93 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  26.26 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  26.76 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  25.54 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  20.03 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  25.94 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  25.94 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  23.93 
 
 		 646 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  26.36 
 
 		 678 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  24.29 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  24.82 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  25.41 
 
 		 714 aa  74.7  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  27.59 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  25.18 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  25.09 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  28.42 
 
 		 668 aa  71.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  25.37 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  24.84 
 
 		 370 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  26.06 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  26.76 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  27.08 
 
 		 670 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  28.01 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  25.7 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  23.47 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  27.44 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  22.54 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  23.83 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  22.54 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  23.67 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  23.59 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  23.77 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  23.77 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  25.74 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  24.61 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  26.35 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.83 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  22.87 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  25.82 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  21.83 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.35 
 
 		 702 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  22.05 
 
 		 616 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.38 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  22.71 
 
 		 777 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  21.67 
 
 		 773 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  22.22 
 
 		 621 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  37.21 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  25.07 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  26.59 
 
 		 520 aa  47.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  25.45 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  36.67 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  28.38 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  28.03 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  26.35 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  28.09 
 
 		 519 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  35.11 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.8 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  35.56 
 
 		 447 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>