109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3028 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  100 
 
 		 440 aa  919    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.82 
 
 		 637 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.44 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  29.41 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  27.86 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  27.59 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.61 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  27.96 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.26 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  28.22 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  29.28 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  23.9 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  28 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  24.91 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.69 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4485  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.16 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133159  normal  0.0285057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  26.67 
 
 		 539 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  26.48 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  25.3 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  24.41 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  23.33 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  25.08 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  24.72 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  27.7 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  24.41 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  26.61 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.71 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  26.21 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  25.44 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.25 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  21.02 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  24.22 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  25.93 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.5 
 
 		 1298 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  22.46 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  24.13 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11069  alkaline phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03860)  24.65 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  26.73 
 
 		 519 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  25.34 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  24.56 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  23.56 
 
 		 545 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  24.93 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  23.08 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  22.04 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  22.82 
 
 		 532 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  23.68 
 
 		 513 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  23.53 
 
 		 511 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  24.32 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  23.35 
 
 		 559 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  23.78 
 
 		 529 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  25.89 
 
 		 576 aa  53.5  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.73 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  24.09 
 
 		 534 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  23.48 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 		 530 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  23.99 
 
 		 588 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  23.99 
 
 		 588 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  24.52 
 
 		 540 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  22.93 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  23.53 
 
 		 529 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.03 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  25.49 
 
 		 674 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.69 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  22.8 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  24.09 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  24.19 
 
 		 588 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  22.81 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.29 
 
 		 573 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  21.13 
 
 		 489 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  22.63 
 
 		 530 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45174  predicted protein  28.46 
 
 		 473 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  21.13 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  22.12 
 
 		 524 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  23.44 
 
 		 573 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  24.43 
 
 		 588 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  24.43 
 
 		 588 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  23.23 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  21.13 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  30.34 
 
 		 589 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  24.43 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  24.43 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  24.12 
 
 		 526 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  23.8 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.9 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  21.66 
 
 		 552 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  21.79 
 
 		 549 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  22.85 
 
 		 529 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.44 
 
 		 524 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  26.94 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  23.34 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  23.72 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  24.66 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  24.52 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  20.97 
 
 		 641 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  24.24 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 		 585 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  51.52 
 
 		 679 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>