64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1884 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1292    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  40.79 
 
 
621 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  29.29 
 
 
616 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  29.55 
 
 
616 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  29.11 
 
 
617 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  30.36 
 
 
619 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  29.33 
 
 
668 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  28.95 
 
 
655 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  28.7 
 
 
639 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  27.41 
 
 
622 aa  194  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  28.77 
 
 
632 aa  193  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  27.76 
 
 
659 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  29.78 
 
 
633 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  28.4 
 
 
670 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  29.38 
 
 
628 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  30.66 
 
 
577 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  29.59 
 
 
628 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  29.73 
 
 
615 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  29.81 
 
 
615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  28.5 
 
 
671 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  28.08 
 
 
628 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  29.06 
 
 
616 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  29.25 
 
 
616 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  26.77 
 
 
626 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  27.59 
 
 
650 aa  180  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  27.34 
 
 
661 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  28.7 
 
 
648 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  26.15 
 
 
649 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  27.2 
 
 
646 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  27.61 
 
 
648 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  28.57 
 
 
623 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  28.13 
 
 
777 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  28.52 
 
 
678 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  28.33 
 
 
708 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  28.63 
 
 
714 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  29.92 
 
 
706 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  27.93 
 
 
773 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  32.62 
 
 
477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  33.59 
 
 
370 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  25.94 
 
 
531 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  26.64 
 
 
548 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.41 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  27.13 
 
 
552 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  23.93 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  23.23 
 
 
534 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  24.22 
 
 
565 aa  57  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  22.05 
 
 
559 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  24.4 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  24.71 
 
 
546 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  29.3 
 
 
233 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  24.6 
 
 
540 aa  54.7  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  24.37 
 
 
561 aa  55.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.05 
 
 
520 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  21.65 
 
 
569 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  21.65 
 
 
569 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  23.69 
 
 
540 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  21.65 
 
 
569 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  21.74 
 
 
535 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.55 
 
 
702 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  21.71 
 
 
542 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  23.8 
 
 
636 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  21.52 
 
 
469 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  22.92 
 
 
590 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  32.89 
 
 
577 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>