71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1225 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1122    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  49.54 
 
 		 534 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  45.17 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  44.46 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  43.91 
 
 		 520 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  42.2 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  44.44 
 
 		 550 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  42.42 
 
 		 559 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  43.65 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  43.15 
 
 		 531 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  42.93 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  40.19 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  44.62 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  43.84 
 
 		 546 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  39.7 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  39.7 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  39.7 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  40.89 
 
 		 540 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  41.61 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  38.39 
 
 		 542 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  39.76 
 
 		 577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  39.82 
 
 		 540 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  25.83 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  27.47 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  24.05 
 
 		 661 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  28.74 
 
 		 639 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  23.66 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  24.14 
 
 		 622 aa  70.1  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  25.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  25 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  27.94 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  27.24 
 
 		 670 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  27.31 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  23.06 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  23.06 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  25.08 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  22.93 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  25 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  24.32 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  22.64 
 
 		 649 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  26.21 
 
 		 621 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  22.94 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  22.94 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.82 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  22.73 
 
 		 633 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  20.98 
 
 		 577 aa  57  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  26.85 
 
 		 650 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  24.8 
 
 		 619 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  22.86 
 
 		 616 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  26.42 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  26.02 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  35.44 
 
 		 708 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  25.61 
 
 		 616 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  22.5 
 
 		 628 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  22.5 
 
 		 628 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  24.6 
 
 		 706 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  22.5 
 
 		 616 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  21.16 
 
 		 777 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  24.01 
 
 		 655 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  21.78 
 
 		 773 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  27.61 
 
 		 460 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.09 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  23.76 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  24.75 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  24.9 
 
 		 648 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  23.2 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  25.81 
 
 		 659 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  23.82 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  23.72 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  29.63 
 
 		 702 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  25.66 
 
 		 541 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>