30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4509 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1094    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  34.95 
 
 
492 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  27.73 
 
 
500 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  27.73 
 
 
534 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  27.25 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  27.97 
 
 
474 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87049  predicted protein  25.98 
 
 
704 aa  140  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0290903  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09466  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03582  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
1229 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406645  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00770  plasma membrane protein, putative  24.33 
 
 
692 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867124  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05776  WW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G06520)  23.01 
 
 
1208 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  25.89 
 
 
535 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  24.93 
 
 
566 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  24.7 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  24.52 
 
 
552 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  25.07 
 
 
550 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  20.63 
 
 
475 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  24.7 
 
 
548 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  25.07 
 
 
559 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  25.57 
 
 
540 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  31.18 
 
 
590 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.91 
 
 
702 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  24.83 
 
 
633 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  30.39 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  22.75 
 
 
569 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  22.75 
 
 
569 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  22.75 
 
 
569 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  25.08 
 
 
577 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  24.29 
 
 
565 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  23.59 
 
 
639 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>