32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0424 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  965    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  53.09 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  47.25 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  47.25 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  27.25 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  27.62 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87049  predicted protein  23.36 
 
 		 704 aa  100  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0290903  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03582  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 1229 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406645  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09466  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00770  plasma membrane protein, putative  25.46 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867124  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05776  WW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G06520)  25.75 
 
 		 1208 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1866  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  43.16 
 
 		 114 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.892343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  27.37 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.8 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  27.33 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  27.3 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  25.45 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.71 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.16 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  25.11 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  25.59 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  24.1 
 
 		 569 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  26.06 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  24.1 
 
 		 569 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  24.1 
 
 		 569 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  30.2 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  24.94 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  23.9 
 
 		 540 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  24.8 
 
 		 552 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  27.27 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  28.03 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  31 
 
 		 557 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>