26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3876 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 947 aa  1931    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.91 
 
 		 1051 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  28.93 
 
 		 1174 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1582  spore coat protein CotH  31.55 
 
 		 527 aa  218  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2160  hypothetical protein  26.77 
 
 		 797 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  48.61 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6191  hypothetical protein  29.45 
 
 		 855 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  21.82 
 
 		 621 aa  61.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3012  hypothetical protein  22.54 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6639  hypothetical protein  29 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  41.98 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  23.76 
 
 		 702 aa  51.2  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1580  L-glutaminase  30.93 
 
 		 817 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.358797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  36.49 
 
 		 716 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  28.41 
 
 		 898 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  21.03 
 
 		 500 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.67 
 
 		 940 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0163  hypothetical protein  41.67 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1712  hypothetical protein  24.63 
 
 		 807 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0116958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 599 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.67 
 
 		 639 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  19.59 
 
 		 673 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1444  hypothetical protein  34.15 
 
 		 807 aa  47  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.239906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  37.66 
 
 		 514 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  36 
 
 		 848 aa  45.8  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1611  hypothetical protein  32.88 
 
 		 313 aa  45.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>