16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3872 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1118    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  53.28 
 
 		 537 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  43.74 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  42.53 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  36.6 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.42 
 
 		 982 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1600  hypothetical protein  24.47 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.73 
 
 		 726 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.76 
 
 		 688 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.75 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  21.92 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  26.67 
 
 		 630 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.6 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  21.13 
 
 		 1410 aa  47.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  29.17 
 
 		 1217 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  23.31 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>