More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  100 
 
 		 1591 aa  3118    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  57.31 
 
 		 1577 aa  1453    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  55.23 
 
 		 1577 aa  1366    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  49.33 
 
 		 1512 aa  1169    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  57.13 
 
 		 1652 aa  1412    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.21 
 
 		 1525 aa  1189    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  57.45 
 
 		 1506 aa  1353    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.11 
 
 		 929 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  50.37 
 
 		 1311 aa  559  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  44.96 
 
 		 902 aa  543  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  48.42 
 
 		 870 aa  529  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  36.66 
 
 		 826 aa  323  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  34.78 
 
 		 795 aa  322  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.6 
 
 		 868 aa  283  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  37.54 
 
 		 750 aa  278  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.17 
 
 		 1266 aa  262  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  27.72 
 
 		 2667 aa  257  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.49 
 
 		 601 aa  246  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.12 
 
 		 826 aa  246  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 731 aa  246  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 		 945 aa  245  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.42 
 
 		 940 aa  245  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  28.09 
 
 		 2775 aa  240  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.14 
 
 		 624 aa  239  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.14 
 
 		 624 aa  239  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.14 
 
 		 624 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  35.14 
 
 		 624 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.32 
 
 		 818 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  35.14 
 
 		 624 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  35.14 
 
 		 624 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  30.59 
 
 		 948 aa  238  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  30.09 
 
 		 948 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.55 
 
 		 818 aa  234  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  35.38 
 
 		 622 aa  234  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.29 
 
 		 848 aa  234  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 		 1641 aa  234  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  31.89 
 
 		 948 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 		 944 aa  233  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.09 
 
 		 578 aa  232  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 		 1284 aa  232  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 		 955 aa  232  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.2 
 
 		 1075 aa  231  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 		 1641 aa  231  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.99 
 
 		 573 aa  229  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.35 
 
 		 1148 aa  228  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  30.13 
 
 		 1346 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.23 
 
 		 942 aa  226  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.15 
 
 		 942 aa  225  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  32.87 
 
 		 780 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.24 
 
 		 947 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  32.31 
 
 		 780 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.78 
 
 		 722 aa  223  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  35.82 
 
 		 514 aa  221  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 		 1148 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  32.91 
 
 		 944 aa  221  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  32.64 
 
 		 558 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  32.87 
 
 		 948 aa  220  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  32.91 
 
 		 944 aa  220  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  32.91 
 
 		 944 aa  220  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.69 
 
 		 603 aa  220  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  33.07 
 
 		 944 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  31.99 
 
 		 1503 aa  218  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.06 
 
 		 588 aa  217  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  31.54 
 
 		 555 aa  217  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 		 604 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.45 
 
 		 2346 aa  217  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 		 604 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 		 604 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  32.27 
 
 		 655 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.97 
 
 		 621 aa  216  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.8 
 
 		 604 aa  211  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  32.07 
 
 		 559 aa  211  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.22 
 
 		 600 aa  210  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 		 604 aa  210  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 		 627 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.36 
 
 		 1052 aa  207  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  31.79 
 
 		 607 aa  207  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 586 aa  207  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  28.5 
 
 		 1310 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 604 aa  206  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.24 
 
 		 620 aa  205  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  30.24 
 
 		 578 aa  205  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.24 
 
 		 599 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.24 
 
 		 620 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 		 481 aa  202  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.23 
 
 		 557 aa  202  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  33.45 
 
 		 597 aa  202  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.87 
 
 		 567 aa  201  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  31.36 
 
 		 560 aa  201  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.22 
 
 		 810 aa  201  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  30.16 
 
 		 529 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.08 
 
 		 653 aa  201  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  30.16 
 
 		 529 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  33.17 
 
 		 572 aa  201  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  29.98 
 
 		 529 aa  199  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  29.98 
 
 		 529 aa  199  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  29.63 
 
 		 529 aa  199  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  30.34 
 
 		 529 aa  198  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  29.63 
 
 		 529 aa  198  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  31.11 
 
 		 575 aa  197  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>