More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2368 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  100 
 
 
578 aa  1176    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.2 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  44.4 
 
 
555 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  42.11 
 
 
571 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  43.07 
 
 
558 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  42.13 
 
 
560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  42.6 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  42.59 
 
 
559 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  40.93 
 
 
580 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  42.17 
 
 
575 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  41.3 
 
 
607 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  39.67 
 
 
588 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.69 
 
 
567 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  38.62 
 
 
560 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  38.8 
 
 
655 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.25 
 
 
560 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.07 
 
 
578 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.27 
 
 
567 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.48 
 
 
604 aa  359  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  40.86 
 
 
585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  37.2 
 
 
583 aa  326  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  36.61 
 
 
602 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  39.32 
 
 
569 aa  321  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  36.86 
 
 
597 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  36.58 
 
 
556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  33.62 
 
 
529 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  33.62 
 
 
529 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.83 
 
 
722 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  33.62 
 
 
529 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  33.45 
 
 
529 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  33.62 
 
 
529 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  33.45 
 
 
529 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  33.33 
 
 
529 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  33.1 
 
 
529 aa  300  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  32.93 
 
 
529 aa  296  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.93 
 
 
529 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.6 
 
 
561 aa  296  9e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.22 
 
 
530 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  33.03 
 
 
529 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  32.84 
 
 
529 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  32.23 
 
 
529 aa  290  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  32.23 
 
 
529 aa  290  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  32.81 
 
 
529 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  32.17 
 
 
529 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  32.06 
 
 
529 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  32.06 
 
 
529 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.93 
 
 
529 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  31.99 
 
 
529 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.26 
 
 
571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  34.93 
 
 
580 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  36.06 
 
 
580 aa  279  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.58 
 
 
731 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  31.92 
 
 
574 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  31.01 
 
 
575 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  32.45 
 
 
581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  34.33 
 
 
1512 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.64 
 
 
1525 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.59 
 
 
509 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  33.57 
 
 
1652 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  32.65 
 
 
1577 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.37 
 
 
1577 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  35.08 
 
 
752 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  33.06 
 
 
870 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.74 
 
 
578 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.65 
 
 
1506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  32.34 
 
 
1311 aa  219  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  33.09 
 
 
690 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.29 
 
 
586 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  30.24 
 
 
1591 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.93 
 
 
504 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  29.79 
 
 
583 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  31.44 
 
 
765 aa  190  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.52 
 
 
1181 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.15 
 
 
1175 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.57 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.35 
 
 
518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  30.18 
 
 
518 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.14 
 
 
558 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30 
 
 
518 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  30 
 
 
518 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  30 
 
 
518 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.38 
 
 
1202 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.38 
 
 
1215 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  27.01 
 
 
826 aa  174  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.27 
 
 
607 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.68 
 
 
508 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.92 
 
 
516 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  27.98 
 
 
530 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.67 
 
 
517 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.22 
 
 
605 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.78 
 
 
517 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.61 
 
 
508 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.61 
 
 
508 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.25 
 
 
872 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.4 
 
 
555 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.24 
 
 
523 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.64 
 
 
515 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.82 
 
 
533 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.24 
 
 
523 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  26.36 
 
 
633 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>