More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0143 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 575 aa  1161    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  50.82 
 
 		 602 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.9 
 
 		 578 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  45.52 
 
 		 588 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.11 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.28 
 
 		 567 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.58 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  46.25 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  44.1 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  43.47 
 
 		 655 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  42.57 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  42.96 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  42.88 
 
 		 560 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  42.25 
 
 		 555 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  42.17 
 
 		 578 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.95 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  42.81 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  39.63 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  40.82 
 
 		 569 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.26 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.41 
 
 		 529 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  37.37 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  36.89 
 
 		 529 aa  353  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  36.89 
 
 		 529 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  37.13 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  36.71 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  36.89 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  36.71 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  36.89 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  37.06 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.4 
 
 		 722 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  36.31 
 
 		 529 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  36.31 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  36.5 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  37.08 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.95 
 
 		 529 aa  319  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  36.51 
 
 		 556 aa  317  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  35.51 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  35.91 
 
 		 571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  34.46 
 
 		 578 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.99 
 
 		 560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  33.75 
 
 		 560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  31.62 
 
 		 580 aa  272  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  34.45 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 1525 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 731 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  33.57 
 
 		 1512 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  34.95 
 
 		 870 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  32.12 
 
 		 583 aa  251  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  33.68 
 
 		 1577 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.69 
 
 		 561 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.69 
 
 		 571 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  31.73 
 
 		 575 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  31.92 
 
 		 574 aa  237  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  32.82 
 
 		 1506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  31.64 
 
 		 1652 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  32.24 
 
 		 1311 aa  230  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  30.32 
 
 		 580 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  33.1 
 
 		 752 aa  228  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.92 
 
 		 1577 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  31.51 
 
 		 690 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  30.36 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  31.11 
 
 		 1591 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  28.37 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  29.05 
 
 		 765 aa  183  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.91 
 
 		 607 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.84 
 
 		 504 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.17 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 1284 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.05 
 
 		 1181 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  29.52 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.05 
 
 		 1175 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.91 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  28.78 
 
 		 518 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.04 
 
 		 518 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  29.2 
 
 		 518 aa  153  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.6 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.31 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 627 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.59 
 
 		 1202 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  28.18 
 
 		 657 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.22 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.83 
 
 		 1215 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.21 
 
 		 555 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.81 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  28.11 
 
 		 659 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.06 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.33 
 
 		 750 aa  140  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.05 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.55 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>