More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1029 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
752 aa  1533    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  47.42 
 
 
765 aa  625  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  46.81 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  37.2 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  37.2 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  37.2 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.76 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  37.01 
 
 
529 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  37.9 
 
 
529 aa  278  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  37.01 
 
 
529 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  37.95 
 
 
529 aa  277  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  37.2 
 
 
529 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  37.01 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  37.57 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  37.57 
 
 
529 aa  275  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  37.57 
 
 
529 aa  275  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  37.01 
 
 
529 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.21 
 
 
530 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  37.71 
 
 
529 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  37.38 
 
 
529 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  37.19 
 
 
529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  37.19 
 
 
529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.14 
 
 
529 aa  270  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  36.64 
 
 
529 aa  270  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  34.41 
 
 
556 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.69 
 
 
722 aa  245  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  34.18 
 
 
580 aa  241  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.08 
 
 
509 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  33.1 
 
 
575 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  35.08 
 
 
578 aa  228  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.82 
 
 
588 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  31.83 
 
 
558 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.74 
 
 
567 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.92 
 
 
567 aa  212  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  31.05 
 
 
560 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.69 
 
 
578 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  31.32 
 
 
569 aa  206  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.19 
 
 
604 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  32.79 
 
 
580 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.31 
 
 
557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  29.36 
 
 
574 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  31.65 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  30.91 
 
 
580 aa  198  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.41 
 
 
560 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  30.04 
 
 
559 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  30.23 
 
 
560 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.87 
 
 
561 aa  190  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  28.15 
 
 
575 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  27.6 
 
 
571 aa  187  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  29.12 
 
 
607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  30.77 
 
 
581 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  31.07 
 
 
655 aa  184  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  32.01 
 
 
611 aa  183  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  30.14 
 
 
585 aa  183  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  30.62 
 
 
602 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.4 
 
 
571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  29.32 
 
 
597 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.71 
 
 
504 aa  151  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.54 
 
 
1284 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  30.11 
 
 
583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  27.87 
 
 
583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.74 
 
 
1215 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.36 
 
 
1202 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.04 
 
 
1181 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.91 
 
 
1175 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.87 
 
 
508 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  27.94 
 
 
530 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  27.95 
 
 
1577 aa  125  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.27 
 
 
731 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.26 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.25 
 
 
1525 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  26.89 
 
 
1311 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.26 
 
 
1512 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.14 
 
 
627 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.41 
 
 
607 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.15 
 
 
657 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.81 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  25.3 
 
 
1591 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  25.49 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  27.72 
 
 
1506 aa  111  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.58 
 
 
578 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.32 
 
 
638 aa  111  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.01 
 
 
508 aa  111  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.01 
 
 
508 aa  111  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.77 
 
 
605 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.17 
 
 
555 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  28.23 
 
 
870 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  24.57 
 
 
663 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.19 
 
 
659 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.83 
 
 
532 aa  107  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.69 
 
 
509 aa  107  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  25.65 
 
 
1577 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.24 
 
 
587 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  25.13 
 
 
1652 aa  101  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  25.93 
 
 
523 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.28 
 
 
526 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  26.17 
 
 
533 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.43 
 
 
523 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.44 
 
 
533 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  25.09 
 
 
558 aa  98.6  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>