More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1414 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  100 
 
 		 560 aa  1154    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  96.96 
 
 		 560 aa  1126    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  45.37 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.4 
 
 		 557 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  38.62 
 
 		 578 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  39.46 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  38.58 
 
 		 559 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  38.52 
 
 		 607 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  38.68 
 
 		 558 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  38.95 
 
 		 555 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  36.67 
 
 		 655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  35.89 
 
 		 529 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  36.49 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  36.29 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  35.73 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  35.73 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  36.49 
 
 		 529 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  35.54 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.92 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  35.54 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  35.54 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.81 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  36.5 
 
 		 611 aa  320  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.52 
 
 		 530 aa  319  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.36 
 
 		 567 aa  316  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  36.09 
 
 		 580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  35.21 
 
 		 529 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  35.21 
 
 		 529 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  35.35 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  35.54 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  35.35 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  35.35 
 
 		 529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  36.13 
 
 		 529 aa  309  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  35 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  35.65 
 
 		 529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.82 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.78 
 
 		 529 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  36.01 
 
 		 585 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.85 
 
 		 722 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.96 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  34.93 
 
 		 569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  35.07 
 
 		 556 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  34.33 
 
 		 597 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  33.16 
 
 		 583 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  34.22 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 		 731 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  33.7 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.49 
 
 		 509 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  30.88 
 
 		 575 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  29.91 
 
 		 574 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  32.16 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.26 
 
 		 561 aa  236  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  31.8 
 
 		 580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  30.29 
 
 		 583 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  29.53 
 
 		 1577 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.24 
 
 		 586 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.52 
 
 		 1525 aa  211  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  29.59 
 
 		 580 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  30.73 
 
 		 581 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 571 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.1 
 
 		 1512 aa  203  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  30.45 
 
 		 870 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.89 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  27.38 
 
 		 1652 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.13 
 
 		 504 aa  197  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  30.23 
 
 		 752 aa  194  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  27.95 
 
 		 1506 aa  193  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.37 
 
 		 1577 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  30.09 
 
 		 765 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.75 
 
 		 1311 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  26.21 
 
 		 1591 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.83 
 
 		 826 aa  176  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  30.8 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 518 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  30.61 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.12 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 517 aa  167  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  30.42 
 
 		 518 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.89 
 
 		 517 aa  163  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.44 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  26.89 
 
 		 690 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.32 
 
 		 508 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.32 
 
 		 508 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.39 
 
 		 530 aa  153  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.86 
 
 		 657 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 872 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 		 659 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.68 
 
 		 539 aa  143  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.67 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.48 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.55 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.48 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.71 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.81 
 
 		 750 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 605 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.3 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.15 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.5 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>