59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2174 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1269    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  47.64 
 
 		 856 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  54.98 
 
 		 837 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  39.85 
 
 		 786 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  41.27 
 
 		 802 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  44.7 
 
 		 841 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 824 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  43.97 
 
 		 825 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45 
 
 		 1094 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  42.29 
 
 		 833 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  45.77 
 
 		 809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  39.78 
 
 		 759 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  42.49 
 
 		 864 aa  354  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  42.89 
 
 		 842 aa  353  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  38.05 
 
 		 816 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  39.57 
 
 		 811 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  47.4 
 
 		 781 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  42.21 
 
 		 825 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  37.89 
 
 		 768 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.09 
 
 		 784 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  39.11 
 
 		 822 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  40.3 
 
 		 790 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  39.13 
 
 		 868 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  38.83 
 
 		 741 aa  326  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  37.88 
 
 		 747 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 		 781 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  46.64 
 
 		 808 aa  319  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1139 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  31.87 
 
 		 758 aa  318  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  35.47 
 
 		 778 aa  316  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  41.39 
 
 		 757 aa  316  8e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  47.62 
 
 		 762 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  42.11 
 
 		 742 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  40.17 
 
 		 803 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  37.96 
 
 		 1193 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.41 
 
 		 1479 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 		 835 aa  300  7e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  39.4 
 
 		 991 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  40.43 
 
 		 940 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  37.22 
 
 		 831 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.4 
 
 		 1164 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  39.75 
 
 		 819 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  38.44 
 
 		 760 aa  280  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  34.03 
 
 		 796 aa  254  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  34.92 
 
 		 788 aa  253  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  34.89 
 
 		 809 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  37.27 
 
 		 773 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  27.75 
 
 		 804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.98 
 
 		 943 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  32.26 
 
 		 809 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  28.64 
 
 		 770 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  30.8 
 
 		 753 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  23.82 
 
 		 928 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  21.87 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  38.74 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  41.13 
 
 		 262 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  41.84 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1176 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0256  hypothetical protein  33.73 
 
 		 328 aa  51.2  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.164898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>