56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1614 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  61.71 
 
 		 757 aa  785    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  100 
 
 		 753 aa  1493    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  35.82 
 
 		 809 aa  344  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  26.56 
 
 		 803 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  29.77 
 
 		 741 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.58 
 
 		 1094 aa  180  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.07 
 
 		 784 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  25.32 
 
 		 928 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  25.87 
 
 		 759 aa  170  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 824 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  24.97 
 
 		 1193 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 757 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  25.54 
 
 		 811 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  23.63 
 
 		 816 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  24.9 
 
 		 822 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  25.29 
 
 		 825 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1139 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  25.44 
 
 		 842 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  25.99 
 
 		 825 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  25.41 
 
 		 768 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  24.52 
 
 		 758 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  25.46 
 
 		 940 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  25.09 
 
 		 868 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  28.38 
 
 		 742 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  24.93 
 
 		 841 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  25.29 
 
 		 802 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  31.93 
 
 		 837 aa  147  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  27.53 
 
 		 991 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  28.3 
 
 		 864 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 781 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  31.71 
 
 		 646 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  28.73 
 
 		 790 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 747 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  28.49 
 
 		 809 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  23.2 
 
 		 833 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  24.26 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  27.74 
 
 		 781 aa  134  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  25.41 
 
 		 786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  23.88 
 
 		 1164 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  25.12 
 
 		 1479 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  32.58 
 
 		 808 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  24.09 
 
 		 778 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  28.08 
 
 		 856 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  25.05 
 
 		 796 aa  121  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  27.43 
 
 		 762 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  28.89 
 
 		 831 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  26.2 
 
 		 943 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 835 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  24.41 
 
 		 788 aa  116  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  26.44 
 
 		 804 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  27.78 
 
 		 773 aa  100  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  29.44 
 
 		 819 aa  99.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  22.48 
 
 		 809 aa  92  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  21.96 
 
 		 770 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  20.84 
 
 		 750 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  31.17 
 
 		 262 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>