62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8217 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  48.04 
 
 
1193 aa  720    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  55.97 
 
 
742 aa  821    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  52 
 
 
803 aa  750    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  47.46 
 
 
1479 aa  707    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
991 aa  2009    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  45.67 
 
 
790 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  39.52 
 
 
825 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  41.84 
 
 
768 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  40.05 
 
 
825 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  37.73 
 
 
822 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  39.49 
 
 
759 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  38.58 
 
 
868 aa  513  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  38.25 
 
 
816 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.96 
 
 
833 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.31 
 
 
1094 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  38.67 
 
 
842 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  38.78 
 
 
841 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  37.69 
 
 
864 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  40.74 
 
 
741 aa  502  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.57 
 
 
784 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  38.08 
 
 
811 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.03 
 
 
778 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  36.28 
 
 
802 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  36.1 
 
 
781 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  36.26 
 
 
786 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  36.51 
 
 
1164 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  37.16 
 
 
1139 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  38.16 
 
 
747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  36.23 
 
 
796 aa  442  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  37.42 
 
 
940 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  35.4 
 
 
758 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 
835 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.55 
 
 
757 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.2 
 
 
760 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  34.9 
 
 
773 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  34.43 
 
 
831 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 
824 aa  361  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  34.59 
 
 
809 aa  357  8.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  33.46 
 
 
809 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  34.63 
 
 
856 aa  330  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.03 
 
 
943 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  38.97 
 
 
646 aa  298  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.67 
 
 
804 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  32.9 
 
 
762 aa  291  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 
781 aa  280  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  37.94 
 
 
837 aa  257  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.75 
 
 
788 aa  254  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  37.19 
 
 
808 aa  237  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  28.41 
 
 
819 aa  233  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  27.06 
 
 
809 aa  178  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  29.12 
 
 
770 aa  154  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  27.44 
 
 
753 aa  144  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  30.02 
 
 
757 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  35.62 
 
 
262 aa  98.6  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  51.76 
 
 
116 aa  89  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  24.36 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  22.18 
 
 
928 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  34.86 
 
 
846 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.99 
 
 
765 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  31.84 
 
 
564 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  34.84 
 
 
739 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  24.2 
 
 
948 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>