59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1878 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  63.55 
 
 		 833 aa  1111    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  49.29 
 
 		 786 aa  765    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  44.51 
 
 		 842 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 825 aa  1721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  46.9 
 
 		 802 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  55.07 
 
 		 822 aa  927    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  43.59 
 
 		 816 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  47.43 
 
 		 868 aa  741    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  54.77 
 
 		 841 aa  908    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  45.27 
 
 		 825 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  41.74 
 
 		 864 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  42.33 
 
 		 768 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.49 
 
 		 1094 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  41.81 
 
 		 759 aa  598  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  42.38 
 
 		 811 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  40.44 
 
 		 781 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  41.47 
 
 		 778 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  40.88 
 
 		 824 aa  561  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  41.16 
 
 		 741 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  39.64 
 
 		 1193 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.79 
 
 		 784 aa  551  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1139 aa  542  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  39.52 
 
 		 991 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.42 
 
 		 1479 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  39.27 
 
 		 790 aa  539  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  40.21 
 
 		 747 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  42.2 
 
 		 940 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  37.65 
 
 		 803 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  38.88 
 
 		 1164 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  39.01 
 
 		 835 aa  510  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  38.61 
 
 		 856 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  38.31 
 
 		 758 aa  498  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 		 757 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  38.65 
 
 		 742 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  38.55 
 
 		 781 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  35.19 
 
 		 809 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  35.48 
 
 		 837 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  34.45 
 
 		 760 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  35.58 
 
 		 831 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  33.46 
 
 		 796 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  43.97 
 
 		 646 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  33.68 
 
 		 762 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  34.05 
 
 		 808 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.97 
 
 		 788 aa  320  5e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  30.13 
 
 		 819 aa  318  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  31.02 
 
 		 809 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  31.11 
 
 		 773 aa  293  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.75 
 
 		 943 aa  277  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 804 aa  274  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  28.32 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.03 
 
 		 753 aa  157  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  24.01 
 
 		 770 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  30.67 
 
 		 757 aa  134  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  39.23 
 
 		 262 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  25.26 
 
 		 750 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  47.92 
 
 		 116 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  22.59 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1967  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  22.01 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>