58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2699 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  45.72 
 
 		 768 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  54.02 
 
 		 811 aa  916    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.11 
 
 		 1094 aa  724    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  42.82 
 
 		 864 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  45.27 
 
 		 825 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  43.63 
 
 		 833 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  55.73 
 
 		 842 aa  962    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  53.55 
 
 		 816 aa  940    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  44.67 
 
 		 741 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  42.87 
 
 		 868 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 825 aa  1710    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  41.62 
 
 		 822 aa  631  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  40.49 
 
 		 841 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  45.35 
 
 		 759 aa  628  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  45.16 
 
 		 747 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 781 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  47.55 
 
 		 940 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  41.6 
 
 		 802 aa  606  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  40.89 
 
 		 778 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.28 
 
 		 784 aa  586  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1139 aa  576  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  40.77 
 
 		 786 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  41.42 
 
 		 790 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 1164 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  40.16 
 
 		 1479 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 		 757 aa  537  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  36.97 
 
 		 1193 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  40.05 
 
 		 991 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  40.08 
 
 		 742 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 		 835 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  39.6 
 
 		 803 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  37.98 
 
 		 758 aa  486  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  35.1 
 
 		 760 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  35.75 
 
 		 809 aa  432  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 824 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  35.64 
 
 		 837 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  36.46 
 
 		 831 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  33.79 
 
 		 856 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  35.88 
 
 		 781 aa  396  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  33.21 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  34.17 
 
 		 762 aa  342  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  42.21 
 
 		 646 aa  336  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.64 
 
 		 788 aa  318  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.16 
 
 		 773 aa  303  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 		 808 aa  298  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  28.69 
 
 		 819 aa  287  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.9 
 
 		 809 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.89 
 
 		 943 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  28.12 
 
 		 804 aa  278  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  28.51 
 
 		 809 aa  234  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  43.86 
 
 		 262 aa  161  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.99 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  22.25 
 
 		 770 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  26.24 
 
 		 757 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.77 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  51.06 
 
 		 116 aa  99  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  21.45 
 
 		 928 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1176 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>