49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3110 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1915    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  29.2 
 
 		 809 aa  294  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.15 
 
 		 753 aa  161  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  27.45 
 
 		 757 aa  137  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  23.65 
 
 		 759 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.95 
 
 		 784 aa  105  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  22.37 
 
 		 1479 aa  105  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  23.77 
 
 		 741 aa  99.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.32 
 
 		 1094 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  22.8 
 
 		 757 aa  92.8  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  24.16 
 
 		 747 aa  92.8  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  21.64 
 
 		 864 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  24.78 
 
 		 790 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 		 824 aa  89.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  22.69 
 
 		 816 aa  84.7  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  21.97 
 
 		 802 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  21.93 
 
 		 868 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  21.71 
 
 		 760 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  23.42 
 
 		 833 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 811 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  23.82 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  22.78 
 
 		 796 aa  75.1  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  20.26 
 
 		 1164 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  23.73 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  20.62 
 
 		 781 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  21.45 
 
 		 825 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  29.39 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  21.35 
 
 		 831 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  22.59 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  22.05 
 
 		 991 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  27.64 
 
 		 758 aa  65.1  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  24.75 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  20.69 
 
 		 822 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.22 
 
 		 943 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  24.25 
 
 		 837 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  27.03 
 
 		 841 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  26.34 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1139 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  31.77 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  21.96 
 
 		 778 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  28.88 
 
 		 809 aa  55.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  27.84 
 
 		 842 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  23.5 
 
 		 804 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  25.12 
 
 		 940 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.53 
 
 		 750 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  27.27 
 
 		 819 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  27.71 
 
 		 856 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  21.07 
 
 		 1193 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  22.77 
 
 		 773 aa  45.8  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>