59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1256 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  45.47 
 
 		 816 aa  682    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  44.87 
 
 		 842 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.44 
 
 		 1094 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1603    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  45.72 
 
 		 825 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  52.57 
 
 		 940 aa  717    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  44.74 
 
 		 811 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  43.88 
 
 		 790 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  42.68 
 
 		 741 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  42.33 
 
 		 825 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  41.99 
 
 		 833 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  40.67 
 
 		 747 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  42.14 
 
 		 868 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  40.28 
 
 		 864 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  42.73 
 
 		 759 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  41.78 
 
 		 841 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  40.48 
 
 		 802 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  41.47 
 
 		 822 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.09 
 
 		 784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  40.49 
 
 		 786 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  43.32 
 
 		 1193 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  40.44 
 
 		 781 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  41.06 
 
 		 1164 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  41.89 
 
 		 1479 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  41.02 
 
 		 991 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  38.57 
 
 		 835 aa  522  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1139 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.55 
 
 		 778 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  39.74 
 
 		 742 aa  512  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  38.08 
 
 		 757 aa  504  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  38.83 
 
 		 803 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  36.48 
 
 		 758 aa  482  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  37.35 
 
 		 760 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  37.88 
 
 		 824 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  33.99 
 
 		 856 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  33.8 
 
 		 809 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  33.41 
 
 		 837 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  36.42 
 
 		 831 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  34.45 
 
 		 796 aa  393  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 781 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  41.19 
 
 		 646 aa  333  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.54 
 
 		 788 aa  324  4e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  32.29 
 
 		 762 aa  314  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  30.02 
 
 		 943 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29.43 
 
 		 804 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.68 
 
 		 773 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  28.89 
 
 		 809 aa  282  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  36.85 
 
 		 808 aa  281  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  28.68 
 
 		 819 aa  273  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  27.85 
 
 		 809 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.13 
 
 		 753 aa  147  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  38.71 
 
 		 262 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  26.44 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  22.91 
 
 		 770 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  21.69 
 
 		 750 aa  97.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  95.1  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  26.34 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1176 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  30.28 
 
 		 1148 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>