57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1435 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 790 aa  1642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  44.27 
 
 		 1193 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  43.34 
 
 		 1479 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  45.86 
 
 		 991 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  43.06 
 
 		 768 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  42.28 
 
 		 803 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  44.44 
 
 		 742 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  41.31 
 
 		 825 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.16 
 
 		 1094 aa  542  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  39.02 
 
 		 841 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  39.22 
 
 		 825 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  39.41 
 
 		 842 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 781 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  38.59 
 
 		 778 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  37.61 
 
 		 816 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  39.37 
 
 		 822 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.83 
 
 		 833 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 		 864 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  36.72 
 
 		 786 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  38.63 
 
 		 811 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  38.63 
 
 		 1139 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  37.64 
 
 		 802 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  38.62 
 
 		 868 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  39.3 
 
 		 759 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  41.8 
 
 		 940 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37 
 
 		 784 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  36.86 
 
 		 835 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  35.16 
 
 		 741 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  35.75 
 
 		 747 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  36 
 
 		 796 aa  446  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  35.65 
 
 		 1164 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  35.23 
 
 		 758 aa  432  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.67 
 
 		 760 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  33.38 
 
 		 757 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  33.46 
 
 		 856 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  32.9 
 
 		 824 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  32.44 
 
 		 809 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  32.21 
 
 		 773 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  32.95 
 
 		 831 aa  353  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  41.06 
 
 		 837 aa  341  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 		 781 aa  341  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  40.3 
 
 		 646 aa  334  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  30.25 
 
 		 788 aa  327  6e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29.31 
 
 		 804 aa  304  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.25 
 
 		 943 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  29.28 
 
 		 762 aa  300  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.18 
 
 		 809 aa  287  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  35.1 
 
 		 819 aa  246  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 		 808 aa  241  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  24.91 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  28.01 
 
 		 770 aa  151  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  29.75 
 
 		 757 aa  114  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  29.85 
 
 		 753 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  24.26 
 
 		 750 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  32.8 
 
 		 262 aa  102  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  46.24 
 
 		 116 aa  90.5  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  24.91 
 
 		 928 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>