60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7192 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  44.74 
 
 		 768 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 811 aa  1681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  45.48 
 
 		 741 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.35 
 
 		 1094 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  61.74 
 
 		 842 aa  1036    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  54.02 
 
 		 825 aa  916    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  51.72 
 
 		 816 aa  886    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  40.98 
 
 		 868 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  43.01 
 
 		 841 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  41.4 
 
 		 864 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  42.13 
 
 		 833 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  42.38 
 
 		 825 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  42.51 
 
 		 747 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  42.23 
 
 		 822 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  43.38 
 
 		 759 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  40.78 
 
 		 1164 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  39.46 
 
 		 802 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  43.31 
 
 		 940 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  38.92 
 
 		 786 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  38.97 
 
 		 781 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 784 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1139 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  38.63 
 
 		 790 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 778 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  39.38 
 
 		 757 aa  512  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  39.03 
 
 		 1193 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  38.13 
 
 		 1479 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  38.08 
 
 		 991 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  38.5 
 
 		 835 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  37.06 
 
 		 760 aa  475  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  36.87 
 
 		 758 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.53 
 
 		 742 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  36.62 
 
 		 803 aa  452  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  37.42 
 
 		 831 aa  428  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  35.58 
 
 		 856 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  36.97 
 
 		 809 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  34.76 
 
 		 837 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  35.39 
 
 		 824 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 		 781 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  34.08 
 
 		 796 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  39.57 
 
 		 646 aa  339  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.5 
 
 		 804 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  33.29 
 
 		 762 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.6 
 
 		 943 aa  317  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  31.13 
 
 		 788 aa  312  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.08 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  28.7 
 
 		 819 aa  275  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.33 
 
 		 809 aa  270  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 808 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  26.54 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.27 
 
 		 753 aa  163  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  46.15 
 
 		 262 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  24.23 
 
 		 770 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  24.6 
 
 		 757 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  49.44 
 
 		 116 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.14 
 
 		 750 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.43 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 928 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4099  hypothetical protein  27.95 
 
 		 794 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.457724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  23.38 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>