61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0071 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  46.45 
 
 		 781 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 835 aa  1733    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  44.6 
 
 		 778 aa  621  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  41.97 
 
 		 1139 aa  614  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  38.57 
 
 		 768 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  39.32 
 
 		 822 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  39.01 
 
 		 825 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  37.1 
 
 		 841 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.17 
 
 		 833 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  39.15 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  37.27 
 
 		 825 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  37.78 
 
 		 868 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  37.64 
 
 		 816 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  38.93 
 
 		 786 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.84 
 
 		 1094 aa  492  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  38.6 
 
 		 842 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  38.83 
 
 		 811 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  36.74 
 
 		 864 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.44 
 
 		 784 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  36.75 
 
 		 790 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  37.5 
 
 		 741 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  37.81 
 
 		 759 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  40.33 
 
 		 940 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  36.87 
 
 		 1479 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  33.12 
 
 		 747 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  35.76 
 
 		 758 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  34.96 
 
 		 803 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  33.29 
 
 		 1193 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  36.42 
 
 		 760 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  35.18 
 
 		 742 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  34.12 
 
 		 991 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  33.12 
 
 		 757 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  32.34 
 
 		 1164 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 824 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  32.22 
 
 		 809 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  31.48 
 
 		 856 aa  364  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  33.67 
 
 		 781 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  32.01 
 
 		 837 aa  344  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  31.74 
 
 		 796 aa  333  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.86 
 
 		 831 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  30.12 
 
 		 788 aa  314  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  39.38 
 
 		 646 aa  299  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  31.85 
 
 		 762 aa  293  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  29.59 
 
 		 773 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.21 
 
 		 809 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  27.03 
 
 		 804 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 808 aa  234  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  27.2 
 
 		 943 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  35.19 
 
 		 819 aa  223  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  24.74 
 
 		 809 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.16 
 
 		 770 aa  111  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  31.14 
 
 		 753 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  30.29 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  31.22 
 
 		 262 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  24.34 
 
 		 750 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  41.27 
 
 		 116 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.8 
 
 		 765 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  32.5 
 
 		 1148 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1176 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1967  hypothetical protein  36.99 
 
 		 80 aa  47.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  24.22 
 
 		 948 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>