53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1707 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1541    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  26.03 
 
 		 770 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 1479 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  25.26 
 
 		 825 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  24.88 
 
 		 781 aa  111  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  22.73 
 
 		 940 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  23.36 
 
 		 1193 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  22.77 
 
 		 825 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  24.26 
 
 		 790 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 		 781 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  23.17 
 
 		 864 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  22.5 
 
 		 816 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  24.37 
 
 		 822 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  25.28 
 
 		 833 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  23.06 
 
 		 759 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  21.69 
 
 		 768 aa  97.4  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.04 
 
 		 1094 aa  94.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  23.53 
 
 		 837 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  23.99 
 
 		 778 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  21.35 
 
 		 760 aa  93.2  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  24.34 
 
 		 841 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  25.3 
 
 		 786 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  20.54 
 
 		 747 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 835 aa  87.4  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  21.46 
 
 		 948 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  21.44 
 
 		 796 aa  84  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  23.62 
 
 		 803 aa  84  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.36 
 
 		 765 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  20.65 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  22.14 
 
 		 811 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  22.67 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  21.06 
 
 		 842 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  22.2 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  23.71 
 
 		 802 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  21.98 
 
 		 741 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  24.15 
 
 		 868 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  23.72 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  23.22 
 
 		 788 aa  77  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  24.36 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  23.18 
 
 		 1164 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1139 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  21.75 
 
 		 856 aa  68.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  21.87 
 
 		 646 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  21.83 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  25.61 
 
 		 809 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  20.4 
 
 		 824 aa  60.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  20.83 
 
 		 773 aa  55.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  22.81 
 
 		 809 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  20.84 
 
 		 753 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  23.53 
 
 		 928 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  21.97 
 
 		 804 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  22.09 
 
 		 943 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  23.54 
 
 		 831 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>